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biocontainers

Annotation of MS peaks using matching on a spectra database.

下载次数: 0状态：自动构建维护者：biocontainers仓库类型：镜像最近更新：8 年前

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W4M LCMS matching

Version: 3.1.1

Short description

Annotation of MS peaks using matching on a spectra database.

Description

This tool performs LC/MS matching on an input list of MZ/RT values, using either a provided in-house single file database or a connection to Peakforest database.

Key features

LCMS annotation.

Functionality

Annotation / MS / L2a Library Spectrum Match
Post-processing

Approaches

Metabolomics / Untargeted

Instrument Data Types

MS / LC-MS / Orbitrap LC-MS
MS / LC-MS / HPLC-MS
MS / LC-MS / UPLC-MS
MS / LC-MS / Centroid LC-MS

Screenshots

Tool Authors

Pierrick Roger (CEA).

Container Contributors

Pierrick Roger (CEA).

Website

[***]

Git Repository

[***]

Installation

For local individual installation:

bash
docker pull docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/lcmsmatching

Usage Instructions

For direct docker usage:

bash
docker run docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/lcmsmatching ...

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