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philipslabs/cf-variant
philipslabs
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1万+ 次下载3 年前更新
google/deepvariant
google
Google开发的Docker镜像google/deepvariant，集成基于深度学习的基因组变异检测工具DeepVariant，可从全基因组（WGS）、全外显子（WES）等测序数据中精准识别单核苷酸变异（SNVs）与插入缺失（indels），无需手动配置复杂环境，简化部署流程，凭借深度学习模型提升变异检测准确性，广泛适用于科研机构及临床基因组分析场景。
22 次收藏100万+ 次下载2 个月前更新
imamiland/variant-forge
imamiland
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1万+ 次下载14 天前更新
ikmb/deepvariant
ikmb
基于DeepVariant的Nextflow管道，用于端到端变异检测，从原始fastQ文件生成多样本VCF，预配置适用于CCGA MedCluster。
359 次下载2 年前更新
variantdev/mod
variantdev
mod是一款通用包管理器，可补充make和variant等任务运行器与构建工具，能将Git/S3/GCS/HTTP中的文件集转化为带版本化依赖管理的可重用模块，适用于各类项目的依赖版本自动更新与配置管理。
50万+ 次下载3 个月前更新
biocontainers/bioconductor-variantannotation
biocontainers
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573 次下载8 年前更新
chatwork/variant
chatwork
容器时代的任务运行器，用于将bash脚本工作流容器化，支持数据流、依赖注入和JSON Schema输入验证。
1 次收藏1万+ 次下载16 小时前更新
rjmashl/variant2
rjmashl
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1万+ 次下载2 年前更新
rtibiocloud/convert_variant_ids
rtibiocloud
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1万+ 次下载1 年前更新
mskcc/roslin-variant-conpair
mskcc
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1万+ 次下载4 年前更新
mskcc/roslin-variant-samtools
mskcc
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5万+ 次下载1 年前更新
biocorecrg/variant_calling
biocorecrg
基于GATK 4（版本4.1.0.0）的变异检测流水线，用于基因组变异分析，支持高效处理基因组数据并进行变异检测。
839 次下载6 年前更新
nfcore/deepvariant
nfcore
nf-core/deepvariant的Docker镜像，用于运行基于Nextflow的Google DeepVariant变异检测管道，支持自动化预处理、多BAM文件并行处理及Docker容器化，适用于全基因组和全外显子测序数据的变异检测分析。
4.1千+ 次下载7 年前更新
webvariants/elasticsearch
webvariants
based on official repositotry with plugins
523 次下载8 年前更新
skipmcgee/rockyvariants
skipmcgee
基于Rocky Linux的变体镜像，预装Python3和rpmbuild工具，适用于RPM包构建、Python应用开发及相关依赖环境搭建场景，提供稳定的基础系统和完整的构建工具链。
1万+ 次下载4 个月前更新
aptxmdzz4869/deepvariant
aptxmdzz4869
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