ghcr.io/yeyuan98/alphafast:5b78342
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ghcr.iolinux/amd645b78342大小: 未知更新于 2026年4月15日
基于AlphaFold 3的超高通量推理镜像，通过MMseqs2-GPU替代Jackhmmer实现同源搜索68倍加速及单H200 GPU端到端推理22倍加速。 支持多GPU线性扩展，4 H200 GPU达8秒/输入，8 H200 GPU达4.5秒/输入；提供无服务器推理选项，单输入成本0.035***、耗时28秒；蛋白质MSA采用MMseqs2-GPU，RNA MSA默认MMseqs-CPU且可 fallback 至nhmmer，DNA链使用空MSA；采用阶段分离并行流水线，实现多GPU 100%利用率。 基于AlphaFold 3模型构建，集成MMseqs2-GPU加速同源搜索，采用JAX/XLA优化计算编译，支持Docker、Singularity/Apptainer容器化部署，依赖HuggingFace预构建蛋白质、RNA MMseqs2及mmCIF数据库。 适用于高通量蛋白质结构预测的科研场景，尤其适合具备多H200 GPU的高性能计算环境；也支持资源有限场景下的无服务器推理，或大规模批量输入处理需求。
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