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neurodebian 镜像详细说明

neurodebian 使用指南

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neurodebian 官方文档

NeuroDebian (arm64v8) Docker镜像文档

镜像概述和主要用途

arm64v8/neurodebian是官方neurodebian镜像的"每架构"仓库,专门用于arm64v8架构构建。NeuroDebian为Debian、Ubuntu及其他衍生操作系统提供大量神经科学研究软件,是神经科学研究的理想环境。

核心功能和特性

  • 提供丰富的神经科学研究软件集合,包括AFNI、FSL、PyMVPA等流行软件包
  • 仅添加NeuroDebian仓库和仓库GPG密钥,保持基础系统精简
  • 支持多种Debian和Ubuntu版本,提供灵活的环境选择
  • 包含"non-free"变体,提供对非DFSG合规软件的访问
  • nd标签反映NeuroDebian软件包版本的后缀

使用场景和适用范围

  • 神经科学研究与开发环境搭建
  • 神经影像数据分析工作流
  • 跨平台神经科学应用测试
  • ARM64架构设备上的神经科学应用部署
  • 需要特定神经科学工具链的CI/CD流程

支持的标签和对应Dockerfile链接

  • jammy, nd22.04
  • jammy-non-free, nd22.04-non-free
  • noble, nd24.04
  • noble-non-free, nd24.04-non-free
  • plucky, nd25.04
  • plucky-non-free, nd25.04-non-free
  • bullseye, nd110
  • bullseye-non-free, nd110-non-free
  • bookworm, nd120
  • bookworm-non-free, nd120-non-free
  • trixie, nd130, latest
  • trixie-non-free, nd130-non-free, non-free
  • forky, nd140
  • forky-non-free, nd140-non-free
  • sid, nd
  • sid-non-free, nd-non-free

详细使用方法和配置说明

基本使用

由于镜像未预下载apt索引,首次使用前需要运行apt-get update:

docker run --rm arm64v8/neurodebian:latest bash -c "apt-get update && apt-get install -y fsl"

交互式运行

docker run -it --rm arm64v8/neurodebian:latest bash

进入容器后,更新并安装所需软件:

apt-get update
apt-get install -y afni fsl pymvpa

Docker Compose配置示例

创建docker-compose.yml文件:

version: '3'
services:
  neurodebian:
    image: arm64v8/neurodebian:latest
    container_name: neurodebian_env
    volumes:
      - ./data:/data
      - ./scripts:/scripts
    working_dir: /data
    tty: true

启动服务:

docker-compose up -d

进入容器:

docker-compose exec neurodebian bash

仓库配置

NeuroDebian APT配置文件位于/etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list。默认启用DFSG合规的main区域:

docker run --rm arm64v8/neurodebian:latest cat /etc/apt/sources.list.d/neurodebian.sources.list

输出示例:

deb [***] wheezy main
deb [***] data main
#deb-src [***] wheezy main

关于非自由版本(-non-free)

-nonfree标签的镜像提供对非DFSG合规软件的访问,这些软件可能有使用限制(如非商业用途)或缺乏原始源代码。使用时需注意相关许可条款:

docker run -it --rm arm64v8/neurodebian:non-free bash

维护和支持信息

  • 维护者: NeuroDebian
  • 获取帮助: Docker社区Slack、Server Fault、Unix & Linux或Stack Overflow
  • 提交问题: [***]
  • 支持架构: amd64、arm64v8、i386
  • 镜像更新: official-images repo's library/neurodebian label

许可证信息

查看镜像中包含软件的许可信息。

与所有Docker镜像一样,此镜像可能包含其他软件,这些软件可能受其他许可证约束(如基础发行版中的Bash等,以及主要软件的任何直接或间接依赖项)。

自动检测到的其他许可信息可在repo-info仓库的neurodebian/目录中找到。

对于任何预构建镜像的使用,镜像用户有责任确保对本镜像的任何使用符合其中包含的所有软件的相关许可。

更多信息

  • 官方网站: neuro.debian.net
  • GitHub仓库: neurodebian/dockerfiles
  • 镜像元数据和传输大小: repo-info repo's repos/neurodebian/ directory
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常见问题

轩辕镜像免费版与专业版有什么区别?

免费版仅支持 Docker Hub 加速,不承诺可用性和速度;专业版支持更多镜像源,保证可用性和稳定速度,提供优先客服响应。

轩辕镜像免费版与专业版有分别支持哪些镜像?

免费版仅支持 docker.io;专业版支持 docker.io、gcr.io、ghcr.io、registry.k8s.io、nvcr.io、quay.io、mcr.microsoft.com、docker.elastic.co 等。

流量耗尽错误提示

当返回 402 Payment Required 错误时,表示流量已耗尽,需要充值流量包以恢复服务。

410 错误问题

通常由 Docker 版本过低导致,需要升级到 20.x 或更高版本以支持 V2 协议。

manifest unknown 错误

先检查 Docker 版本,版本过低则升级;版本正常则验证镜像信息是否正确。

镜像拉取成功后,如何去掉轩辕镜像域名前缀?

使用 docker tag 命令为镜像打上新标签,去掉域名前缀,使镜像名称更简洁。

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