bidossessi/ht_atlas_v1.0

Housekeeping Transcript Atlas v1.0 数据库镜像文档

1. 镜像概述

Housekeeping Transcript Atlas v1.0数据库镜像是专为Housekeeping Transcript Atlas项目设计的数据库容器化解决方案，内置已挂载的数据库，可直接提供该项目相关数据的存储与访问功能，简化数据部署与使用流程。

2. 核心功能与特性

• 版本明确：基于Housekeeping Transcript Atlas v1.0版本构建，确保数据一致性
• 即开即用：包含预配置并已挂载的数据库，无需额外初始化步骤
• 数据集成：内置完整的Housekeeping Transcript Atlas项目数据
• 灵活部署：支持容器化部署，适配多种环境

3. 使用场景与适用范围

• 生物信息学研究中需要访问Housekeeping Transcript Atlas数据的场景
• 相关应用开发、测试环境的数据库快速部署
• 需要稳定版本Housekeeping Transcript Atlas数据支撑的分析任务
• 教学或演示环境中对标准化数据的需求

4. 使用方法与配置说明

4.1 基本部署（docker run）

通过以下命令启动容器：

bash
docker run -d \
  --name hta-db \
  -p <主机端口>:<容器端口> \
  housekeeping-transcript-atlas:1.0

参数说明：

• -d：后台运行容器
• --name hta-db：指定容器名称为hta-db（可自定义）
• -p <主机端口>:<容器端口>：端口映射，将容器内数据库服务端口映射到主机（具体端口需根据数据库类型确定，如未特殊说明，默认使用数据库标准端口）

4.2 数据持久化配置

如需将数据库数据持久化到主机，可通过-v参数挂载主机目录：

bash
docker run -d \
  --name hta-db \
  -p <主机端口>:<容器端口> \
  -v /主机数据路径:/容器内数据库路径 \
  housekeeping-transcript-atlas:1.0

注意：/容器内数据库路径为镜像内部数据库数据存储的默认路径，具体路径需参考镜像内部配置文档。

4.3 容器状态管理

• 查看容器运行状态：

  bash
  docker ps | grep hta-db
  

• 停止容器：

  bash
  docker stop hta-db
  

• 启动已停止的容器：

  bash
  docker start hta-db
  

• 删除容器（需先停止）：

  bash
  docker rm hta-db
  

5. 注意事项

• 该镜像包含已挂载的数据库，首次启动时可能需要一定时间完成数据加载
• 如未配置数据持久化，容器删除后数据将丢失
• 具体数据库连接方式（如用户名、密码、连接字符串）需参考Housekeeping Transcript Atlas项目的数据库访问文档