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UTA Docker镜像是一个预配置的PostgreSQL数据库镜像,集成了转录本(transcripts)和基因组比对(genome alignments)数据,旨在为生物信息学研究提供便捷的转录本与基因组比对信息存储和查询解决方案。通过容器化部署,简化了传统数据库配置及数据导入流程,支持快速启动和使用。
通过以下命令启动UTA数据库容器:
docker run -d -p 5432:5432 --name uta-container biocommons/uta
-d:后台运行容器-p 5432:5432:映射容器PostgreSQL端口到主机--name uta-container:指定容器名称(可自定义)容器启动后,可通过PostgreSQL客户端连接(默认凭据可能需要参考***文档):
psql -h localhost -p 5432 -U <username> -d uta
注:默认用户名、密码及数据库名等配置详情,请查阅***文档。
详细的配置参数(如数据版本、用户权限、持久化存储等)及使用指南,请参考项目***文档:
UTA GitHub仓库
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当返回 402 Payment Required 错误时,表示流量已耗尽,需要充值流量包以恢复服务。
通常由 Docker 版本过低导致,需要升级到 20.x 或更高版本以支持 V2 协议。
先检查 Docker 版本,版本过低则升级;版本正常则验证镜像信息是否正确。
使用 docker tag 命令为镜像打上新标签,去掉域名前缀,使镜像名称更简洁。
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