热门搜索:
biocontainers/batman
biocontainers
自动构建
BATMAN是用于NMR光谱的贝叶斯自动代谢物分析器，可批量处理代谢物NMR共振峰拟合，通过贝叶斯马尔可夫链蒙特卡洛算法自动解卷积共振峰并估计对应代谢物浓度。
下载次数: 0状态：自动构建维护者：biocontainers仓库类型：镜像最近更新：8 年前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明
如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具，协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题，请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
https://xuanyuan.cloud/agents.md
在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
BATMAN
版本: 1.2.1.08
镜像概述和主要用途
BATMAN（Bayesian Automated Metabolite Analyser for NMR spectra）是一款开源软件，用于批量代谢物NMR共振峰拟合。它通过已知代谢物的光谱图谱数据库和贝叶斯马尔可夫链蒙特卡洛算法，实现复杂混合物NMR光谱中共振峰的解卷积，并自动获取相应代谢物的浓度估计。
核心功能和特性
- NMR处理：支持NMR光谱数据的处理与分析
- 注释/NMR：提供NMR光谱的注释功能
- 后处理：包含光谱数据的后处理能力
- 靶向代谢组学方法：适用于靶向代谢组学研究
- 1D NMR数据支持：专门针对1D NMR仪器数据类型
使用场景和适用范围
适用于代谢组学研究中需要对复杂生物混合物的1D NMR光谱进行代谢物定量分析的场景，可用于自动化处理多个光谱数据，支持并行处理以提高效率。
详细使用方法和配置说明
安装
本地单独安装可通过以下命令拉取镜像：
bashdocker pull docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/batman
使用
直接使用Docker运行：
bashdocker run docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/batman ...
工具作者
- Jie Hao（帝国理工学院）
- William Astle
- Maria De Iorio（伦敦大学学院）
- Timothy Ebbels（帝国理工学院）
容器贡献者
- https://github.com/jianlianggao%EF%BC%88%E5%B8%9D%E5%9B%BD%E7%90%86%E5%B7%A5%E5%AD%A6%E9%99%A2%EF%BC%89
- https://github.com/pcm32
相关资源
- 官方网站：[***]
- Git仓库：https://github.com/phnmnl/container-batman.git
参考文献
- Hao, J., et al., Bayesian deconvolution and quantification of metabolites in complex 1D NMR spectra using BATMAN. Nature Protocols. 2014. 9 (6): pp 1416-1427. DOI: 10.1038/nprot.2014.090.
- Liebeke, M., et al., Combining Spectral Ordering with Peak Fitting for One-Dimensional NMR Quantitative Metabolomics. Analytical Chemistry, 2013. 85 (9): pp 4605–4612. DOI: 10.1021/ac400237w.
- Hao, J., et al., BATMAN – an R package for the automated quantification of metabolites from nuclear magnetic resonance spectra using a Bayesian model. Bioinformatics, 2012. 28 (15): pp 2088-90.
- Astle, W., et al., A Bayesian Model of NMR Spectra for the Deconvolution and Quantification of Metabolites in Complex Biological Mixtures. Journal of the American Statistical Association, 2012. 107(500): pp 1259-1271.
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 batman 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/biocontainers/batman:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull biocontainers/batman:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"