biocontainers/container-mtbls-dwnld Docker Image Overview | Metabolights

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biocontainers/container-mtbls-dwnld

自动构建

biocontainers

Metabolights downloader

下载次数: 0状态：自动构建维护者：biocontainers仓库类型：镜像最近更新：9 年前

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W4M Metabolights Downloader

Version: 1.0.0

Short description

Metabolights downloader

Description

The module downloads a Metabolights study and output data in the W4M 3 files format:

Sample metadata.
Variable metadata.
Sample x variable matrix.

Key features

Data import.

Functionality

Other Tools.

Approaches

Metabolomics / Targeted
Metabolomics / Untargeted

Instrument Data Types

MS
NMR

Screenshots

Tool Authors

Pierrick Roger (CEA).

Container Contributors

Pierrick Roger (CEA).

Website

[***]

Git Repository

[***]

Installation

For local individual installation:

bash
docker pull container-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/mtbls-dwnld

Usage Instructions

For direct docker usage:

bash
docker run container-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/mtbls-dwnld -h

Publications

González-beltrán A, Neumann S, Maguire E, Sansone SA, Rocca-serra P. The Risa R/Bioconductor package: integrative data analysis from experimental metadata and back again. BMC Bioinformatics. 2014;15 Suppl 1:S11.
Giacomoni F, Le corguillé G, Monsoor M, et al. Workflow4Metabolomics: a collaborative research infrastructure for computational metabolomics. Bioinformatics. 2015;31(9):1493-5.

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