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biocontainers/galaxy-k8s-runtime

自动构建

biocontainers

PhenoMeNal项目的首个运行时Docker镜像，用于在容器编排器中部署Galaxy——一个支持数据密集型生物医学研究的开放网络平台，提供数据溯源管理、计算方法上下文捕获及交互式分析文档功能。

下载次数: 0状态：自动构建维护者：biocontainers仓库类型：镜像最近更新：7 年前

镜像标签列表与下载命令

Galaxy 镜像文档

镜像概述

Galaxy是一个开放的、基于网络的平台，专为数据密集型生物医学研究设计。本Docker镜像是PhenoMeNal项目的首个运行时版本，用于在容器编排器中部署和运行Galaxy，解决计算依赖型研究结果的可访问性、可重复性和透明性问题。Galaxy自动跟踪和管理数据溯源，支持捕获计算方法的上下文和意图，并通过Galaxy Pages提供交互式分析文档功能。

核心功能与特性

容器化工具平台：支持容器化工具的集成与管理
工作流支持：提供工作流功能，便于复杂分析流程的构建与执行
数据溯源管理：自动跟踪和记录数据处理过程，确保结果可追溯
计算方法上下文捕获：支持记录计算方法的背景和意图
交互式分析文档：通过Galaxy Pages创建交互式Web文档，完整呈现计算分析过程

使用场景与适用范围

适用于生物医学领域的数据密集型研究，特别是需要确保计算分析结果可重复、可访问和透明的场景。研究人员可利用此镜像在容器编排环境中快速部署Galaxy平台，进行基因组学等生物医学数据的分析与研究。

安装与使用方法

安装

本地独立安装可通过以下命令拉取镜像：

bash
docker pull docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/galaxy-k8s-runtime

使用

直接通过Docker运行：

bash
docker run docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/galaxy-k8s-runtime ...

注：... 部分需根据具体需求补充运行参数。

工具作者

Jeremy Goecks（埃默里大学）
Seth C. Schommer（宾夕法尼亚州立大学）
James Taylor（埃默里大学）

容器贡献者

https://github.com/pcm32%EF%BC%88EMBL-EBI%EF%BC%89

官方网站

[***]

Git仓库

https://github.com/phnmnl/container-galaxy-k8s-runtime.git

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 galaxy-k8s-runtime 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/biocontainers/galaxy-k8s-runtime:<标签>

使用方法：

DockerHub 原生拉取命令

docker pull biocontainers/galaxy-k8s-runtime:<标签>

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oldzhang

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