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biocontainers/isatab2json自动构建
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A container image definition for the isatab2json converter from the ISA API
下载次数: 0状态：自动构建维护者：biocontainers仓库类型：镜像最近更新：7 年前
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isatab2json: ISA-Tab to JSON Converter
Version: 1.0.0
Short Description
A container image definition for the isatab2json converter from the ISA API
Description
The ISA API is a Python 3 library that can create, manipulate, and convert ISA formatted content. The isatab2json converter takes a valid ISA-Tab formatted set of files and converts them into a valid ISA-JSON document.
Key features
- Converts ISA-Tab to ISA-JSON.
Functionality
- Other Tools
Approaches
Instrument Data Types
Tool Authors
- ISA Team
Container Contributors
- David Johnson (University of Oxford)
Website
- [***]
Git Repository
- [***]
Installation
For local individual installation:
bashdocker pull docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/isatab2json
Usage Instructions
For direct docker usage:
bashdocker run docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/isatab2json ...
Publications
- Sansone, Susanna-Assunta, Rocca-Serra, Philippe, Gonzalez-Beltran, Alejandra, Johnson, David, & ISA Community. (2016, October 28). ISA Model and Serialization Specifications 1.0. Zenodo. [***]
biocontainers/biocontainers
biocontainers
BioContainers是社区驱动的生物信息学容器项目，基于Docker和rkt技术，提供标准化的生物信息学软件容器，支持基因组学、蛋白质组学等领域，解决软件部署、依赖管理及分析可重复性问题，可集成到本地、云或HPC环境的工作流中。
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1 年前更新
biocontainers/bcftools
biocontainers
BioContainers是社区驱动的生物信息学容器项目，提供标准化Docker和rkt容器，简化生物信息学软件部署与依赖管理，支持本地、HPC及云环境，确保分析可重现性，专注于组学领域工具的容器化解决方案。
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6 年前更新
biocontainers/samtools
biocontainers
BioContainers是社区驱动的生物信息学容器项目，基于Docker和rkt技术，提供标准化的生物信息学软件容器，支持本地、云环境及HPC集群部署，确保软件运行环境一致性和分析可重复性，适用于基因组学、蛋白质组学等组学领域。
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6 年前更新
biocontainers/fastqc
biocontainers
BioContainers是一个社区驱动的项目，提供基于Docker和rkt的生物信息学软件容器，支持标准化部署、可重复分析，适用于本地、云环境及HPC集群，简化生物信息学工具的使用和管理。
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4 年前更新
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biocontainers
暂无描述
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biocontainers/picard-tools
biocontainers
暂无描述
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6 年前更新
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