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biocontainers

nmrglue：一个用于在Python中处理NMR（核磁共振）数据的模块，可与NumPy、SciPy和matplotlib等库结合，提供数据处理、分析和可视化功能，支持多种NMR文件格式转换与处理。

下载次数: 0状态：自动构建维护者：biocontainers仓库类型：镜像最近更新：9 年前

镜像标签列表与下载命令

nmrglue

镜像概述和主要用途

Nmrglue是一个用于在Python中处理NMR（核磁共振）数据的模块。当与NumPy、SciPy和matplotlib包结合使用时，nmrglue提供了一个强大的环境，用于快速开发新的NMR数据处理、分析和可视化方法。此外，nmrglue还提供了连接现有NMR软件包的框架。

核心功能和特性

文件格式支持：能够读取、写入和转换多种NMR文件格式，包括Agilent/Varian、Bruker、NMRPipe、Sparky、SIMPSON和Rowland NMR Toolkit文件。文件在Python中表示为光谱参数字典和NumPy ndarray对象，便于检查、修改和处理。
数据处理功能：提供多种NMR数据处理函数，如变迹、谱图移位、傅里叶变换及其他变换、基线平滑与展平，以及线性预测建模和外推。利用nmrglue函数和NumPy、SciPy的数值例程，可轻松实现新的处理方案。
可视化能力：与matplotlib（或其他Python绘图库）结合，可创建 publication 级别的NMR谱图或交互式检查数据。例如： !谱图示例 !条带图示例
数据分析功能：包含峰拾取、多维线形拟合（峰拟合）和峰积分例程。新分析方法可在Python中快速开发测试，或通过集成Fortran和C/C++代码实现。

使用场景和适用范围

适用于需要处理、分析和可视化NMR数据的科研人员和开发者，尤其适合：

NMR数据的预处理与格式转换
开发新的NMR数据处理算法
生成高质量NMR谱图用于学术发表
连接不同NMR软件工具实现数据互通

工具作者

Jonathan J. Helmus

容器贡献者

https://github.com/korseby (IPB-Halle)

网站

[***]
http://github.com/jjhelmus/nmrglue

Git仓库

https://github.com/phnmnl/container-nmrglue.git

安装说明

本地个人安装：

bash
docker pull docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/nmrglue

使用说明

直接Docker使用：

bash
docker run docker-registry.phenomenal-h2020.eu/phnmnl/nmrglue ...

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 nmrglue 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/biocontainers/nmrglue:<标签>

使用方法：

DockerHub 原生拉取命令

docker pull biocontainers/nmrglue:<标签>

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