热门搜索:
biodepot/dtoxs_alignment
自动构建
biodepot
该镜像使用BWA工具将输入序列与人类参考序列对齐，是生物信息学分析中生成差异表达基因列表的辅助工具。
下载次数: 0状态：自动构建维护者：biodepot仓库类型：镜像最近更新：7 年前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明
如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具，协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题，请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
https://xuanyuan.cloud/agents.md
在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
dtoxs_alignment镜像说明
镜像概述
本镜像用于执行序列对齐步骤，需与biodepot/detox_analysis容器配合使用，最终生成差异表达基因列表。因参考文件和fastq文件体积较大，未随镜像打包，需用户自行提供并挂载到容器指定路径。
核心功能
通过BWA工具完成输入序列与人类参考序列的对齐处理。
使用场景
适用于生物信息学领域的基因序列分析场景，尤其是差异表达基因研究过程中的序列对齐环节。
配置说明
- 准备本地参考文件目录和fastq序列目录；
- 将参考文件目录挂载到容器内
/root/LINCS/References/Broad_UMI/Human_RefSeq/路径； - 将fastq序列目录挂载到容器内
/root/LINCS/Seqs路径。
部署示例
bashdocker run --rm --name detoxs \ -v <本地参考文件目录>:/root/LINCS/References/Broad_UMI/Human_RefSeq/ \ -v <本地fastq序列目录>:/root/LINCS/Seqs \ biodepot/dtoxs_alignment /root/LINCS/Programs/Broad-DGE/run-alignment-analysis.sh
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 dtoxs_alignment 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/biodepot/dtoxs_alignment:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull biodepot/dtoxs_alignment:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
排错
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"