broadinstitute/gatk Docker 镜像 - 轩辕镜像 | Docker 镜像高效稳定拉取服务
broadinstitute/gatkbroadinstitute
这是用于GATK（基因组分析工具包）4.x版本的官方发布仓库，GATK作为生物信息学领域广泛应用的基因组数据分析工具包，其4.x系列版本的正式发布资源均集中于此，为科研人员及开发者提供可靠、规范的版本获取渠道，确保基因组变异检测、数据分析等相关工作能基于官方认证的工具版本高效开展。
117 次收藏下载次数: 0状态：社区镜像维护者：broadinstitute仓库类型：镜像最近更新：11 个月前
Genome Analysis Toolkit 介绍
工具概况
Genome Analysis Toolkit（GATK）由Broad研究所数据科学与数据工程团队开发，提供了多种实用工具，核心功能聚焦于变异发现和基因分型。该工具具备强大的处理引擎和高性能计算支持，能应对各种规模的项目需求。
了解更多GATK相关信息，可访问官网：[***]
许可证信息
本仓库中的GATK版本均由Broad研究所开发，基于BSD（3条款）许可证完全开源。
旧版本获取
如需3.x版本的GATK Docker镜像，可访问：[***]
仓库中的镜像类型
本仓库包含以下两类镜像：
1. 基础镜像（gatkbase）
- 标签格式：
broadinstitute/gatk:gatkbase-1.2.3 - 用途：作为其他GATK标签镜像的基础镜像，供内部依赖使用。
- 特点：更新频率低，版本稳定。
2. 完整发布版镜像
- 标签规则：完整发布的版本会直接以版本号作为标签（如
4.4.0.0等），便于用户快速识别和获取对应版本。
broadinstitute/picard
broadinstitute
用于处理高通量测序（HTS）数据及格式的Java命令行工具集。
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1 个月前更新
broadinstitute/rawls
broadinstitute
暂无描述
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1 年前更新
broadinstitute/dsde-toolbox
broadinstitute
DSDE Toolbox是一个集成多种工具的Docker镜像，提供Vault认证与密钥管理、配置模板渲染、数据库连接及Workbench状态监控等功能，适用于Broad Institute内部开发和运维工作流。
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1 年前更新
broadinstitute/cromwell
broadinstitute
支持WDL语言的工作流管理系统，可在多个平台后端运行
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16 天前更新
broadinstitute/cromwell-drs-localizer
broadinstitute
用于在任务虚拟机(VM)上下载DRS文件的Docker镜像，简化任务环境中DRS格式文件的获取流程。
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16 天前更新
broadinstitute/gtex_rnaseq
broadinstitute
GTEx RNA-seq流程：包含比对（STAR）、质量控制（RNA-SeQC）以及表达定量（RSEM和RNA-SeQC）功能的RNA-seq数据分析管道。
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9 个月前更新
镜像拉取常见问题
使用与功能问题
错误码与失败问题
manifest unknown 错误：镜像不存在或标签错误
manifest unknown 错误
TLS/SSL 证书验证失败：Docker pull 时 HTTPS 证书错误
TLS 证书验证失败
DNS 解析超时：无法解析镜像仓库地址或连接超时
DNS 解析超时
410 Gone 错误：Docker 版本过低导致协议不兼容
410 错误：版本过低
402 Payment Required 错误：流量耗尽错误提示
402 错误：流量耗尽
401 UNAUTHORIZED 错误：身份认证失败或登录信息错误
身份认证失败错误
429 Too Many Requests 错误：请求频率超出专业版限制
429 限流错误
Docker login 凭证保存错误：Cannot autolaunch D-Bus（不影响登录）
凭证保存错误
账号 / 计费 / 权限
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"