broadinstitute/gatk
broadinstitute
这是用于GATK（基因组分析工具包）4.x版本的官方发布仓库，GATK作为生物信息学领域广泛应用的基因组数据分析工具包，其4.x系列版本的正式发布资源均集中于此，为科研人员及开发者提供可靠、规范的版本获取渠道，确保基因组变异检测、数据分析等相关工作能基于官方认证的工具版本高效开展。
117 次收藏下载次数: 0状态：社区镜像维护者：broadinstitute仓库类型：镜像最近更新：1 年前
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如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具，协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题，请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
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在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
Genome Analysis Toolkit 介绍
工具概况
Genome Analysis Toolkit（GATK）由Broad研究所数据科学与数据工程团队开发，提供了多种实用工具，核心功能聚焦于变异发现和基因分型。该工具具备强大的处理引擎和高性能计算支持，能应对各种规模的项目需求。
了解更多GATK相关信息，可访问官网：[[]]
许可证信息
本仓库中的GATK版本均由Broad研究所开发，基于BSD（3条款）许可证完全开源。
旧版本获取
如需3.x版本的GATK Docker镜像，可访问：[[]]
仓库中的镜像类型
本仓库包含以下两类镜像：
1. 基础镜像（gatkbase）
- 标签格式：
broadinstitute/gatk:gatkbase-1.2.3 - 用途：作为其他GATK标签镜像的基础镜像，供内部依赖使用。
- 特点：更新频率低，版本稳定。
2. 完整发布版镜像
- 标签规则：完整发布的版本会直接以版本号作为标签（如
4.4.0.0等），便于用户快速识别和获取对应版本。
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull broadinstitute/gatk:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"