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databrewllc/odk-form-extraction

databrewllc

ODK Forms Extraction是一个微服务,用于从选定项目中提取表单并存储到S3,默认服务器为databrew.org,支持通过配置文件索引项目,可通过Docker部署并集成AWS和ODK认证,便于表单数据的自动化提取与存储。

下载次数: 0状态:社区镜像维护者:databrewllc仓库类型:镜像最近更新:1 年前
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ODK Forms Extraction

镜像概述

ODK Forms Extraction是一个微服务,用于从选定项目中提取表单数据并存储到S3。该服务默认以databrew.org为服务器,通过配置文件管理项目索引,支持Docker化部署,适用于需要自动化提取和存储ODK表单数据的场景。

核心功能与特性

  • 表单提取与存储:从指定项目中提取表单数据并存储到S3
  • 项目索引管理:通过配置文件(config.yml)灵活添加和管理项目
  • 环境依赖管理:使用R renv进行R环境的依赖管理和版本控制
  • Docker化部署:支持Docker构建和本地测试,便于环境一致性
  • 云集成:支持AWS认证和S3存储,可通过环境变量配置访问凭证

使用场景与适用范围

适用于需要定期从ODK Collect项目中提取表单数据并进行云端存储的场景,如数据收集项目、调查数据管理、研究数据采集等,尤其适合需要自动化数据流水线的团队或组织。

使用方法与配置说明

1. 项目贡献指南

克隆仓库

zsh
git clone https://github.com/arytontediarjo/extract-bohemia-kenya-project.git

创建新分支

zsh
git checkout -b feature_branch
git push origin feature_branch

索引新项目

通过修改config.yml文件添加新项目,在配置文件中追加以下内容:

yaml
    - name: [ODK COLLECT中的新项目名称]
      bucket_name: [目标S3桶名称]
      folder_name: [存储文件夹名称]

复现分析环境

项目使用R renv管理依赖,执行以下步骤配置环境:

  1. 进入项目目录:
zsh
cd ..relative_path/odk-form-extraction
  1. 在R环境中运行以下命令:
r
install.packages("renv")
renv::init(bare=TRUE)
renv::restore()
  1. 添加新R包时,需更新依赖锁文件:
r
install.packages('新包名称')
renv::snapshot()

2. Docker使用指南

前置要求

  • 安装Docker Desktop

构建Docker镜像

zsh
docker build -t odk-form-extraction .

本地测试Docker镜像

基础测试:

zsh
docker run odk-form-extraction

带认证环境变量的测试(AWS和ODK认证):

zsh
docker run \
-e AWS_ACCESS_KEY=... \ 
-e AWS_SECRET_ACCESS_KEY=... \
-e AWS_SESSION_TOKEN=... \
-e AWS_REGION='us-east-1' \
-e ODK_CREDENTIALS_SECRETS_NAME='test/odk-credentials' \
odk-form-extraction

3. 推送到Dockerhub

将代码推送到Github远程主分支,通过Github Actions自动完成CI/CD流程:

zsh
git push

镜像将发布到Dockerhub,地址为:databrewllc/odk-form-extraction

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 odk-form-extraction 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/databrewllc/odk-form-extraction:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

DockerHub 原生拉取命令

docker pull databrewllc/odk-form-extraction:<标签>

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