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LocalEGA主仓库提供数据摄取服务，使用Python 3.7+编写，支持通过docker-compose等方式本地部署组件，适用于本地EGA实例的搭建与数据管理。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：egarchive仓库类型：镜像最近更新：5 年前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明
如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具，协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题，请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
https://xuanyuan.cloud/agents.md
在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
Local EGA 主仓库
概述和主要用途
Local EGA主仓库是用于部署本地EGA（European Genome-phenome Archive）实例的解决方案，核心提供数据摄取服务。其代码基于Python 3.7+开发，支持通过docker-compose等工具在本地环境快速部署各组件，帮助用户搭建包含模拟中央EGA的本地EGA实例，用于数据管理和摄取。
核心功能和特性
- 开发语言：采用Python 3.7+编写，确保代码兼容性和可维护性
- 本地部署：提供docker-compose配置，支持在本地环境快速 provision 和部署各组件
- 多部署选项：除docker-compose外，还支持OpenStack（terraform）、Kubernetes/OpenShift（kubernetes）、Docker Swarm（gradle）等多种部署方式
- 测试支持：内置测试套件，部署后可验证实例功能
使用场景和适用范围
适用于需要在本地环境搭建EGA实例的科研机构、数据中心或组织，用于管理基因组学数据的摄取和存储，尤其适合需要本地化数据处理和合规性要求的场景。
使用方法和配置说明
快速安装
通过以下步骤可在本地部署Local EGA实例（包含模拟中央EGA）：
bashcd deploy make -C bootstrap make -j 4 images make up
部署完成后（约几秒时间），即可运行测试套件验证实例功能。
架构
Local EGA的详细架构文档可在ReadTheDocs查看。架构设计确保各组件协同工作，支持本地EGA实例的稳定运行。
其他部署方式
合作伙伴提供了以下额外部署方案：
- OpenStack集群：使用
terraform部署，详见https://github.com/NBISweden/LocalEGA-deploy-terraform - Kubernetes/OpenShift集群：使用
kubernetes部署，详见https://github.com/NBISweden/LocalEGA-deploy-k8s - Docker Swarm集群：使用
gradle部署，详见https://github.com/NBISweden/LocalEGA-deploy-swarm
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 lega-base 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/egarchive/lega-base:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull egarchive/lega-base:<标签>
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