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fairdom/seek

fairdom
自动构建

FAIRDOM-SEEK是基于Web的平台,用于共享异构科学研究数据集、模型、流程和成果,保留它们之间的关联及相关人员和组织信息,基于ISA基础设施并支持语义查询,适用于多领域科研数据管理。

2 次收藏下载次数: 0状态:自动构建维护者:fairdom仓库类型:镜像最近更新:5 天前
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FAIRDOM-SEEK 镜像文档

概述

FAIRDOM-SEEK是一个基于Web的资源平台,核心功能是共享异构科学研究数据集、模型或模拟、流程及研究成果,同时保留这些资源之间的关联,以及相关人员和组织的信息。其底层基于ISA基础设施(一种描述实验如何聚合为更广泛研究的标准格式),并已扩展为可配置形式,适用于生物学以外的领域。平台整合语义技术,支持复杂数据查询,且不影响用户体验。

核心功能与特性

资源共享与关联管理

  • 支持共享多种异构科研资源,包括数据集、模型、模拟、流程和研究成果
  • 自动保留资源间的关联关系,以及相关人员、组织的信息

基于ISA基础设施

  • 采用ISA标准格式,描述单个实验如何聚合为更广泛的研究和调查
  • 对ISA进行扩展并支持配置,可应用于生物学以外的领域

语义技术整合

  • 融入语义技术,支持对数据进行复杂查询
  • 平衡功能强大性与易用性,不增加用户操作负担

使用场景

科研资源共享与管理

  • 科研团队内部共享和管理研究数据、模型及流程
  • 跨组织协作时统一管理研究成果,确保信息一致性

实际应用案例

  • 演示环境:访问Demo查看平台功能
  • 真实科研应用:作为FAIRDOM倡议的一部分,FAIRDOMHub展示了平台在实际科研中的应用

FAIR数据原则支持

  • 作为FAIRDOM initiative的核心组件,助力实现科研数据的FAIR(可查找、可访问、可互操作、可重用)原则

安装与配置

推荐环境

  • 操作系统:Debian或Ubuntu(推荐),其他Linux发行版及macOS可参考特定指南

安装指南

  • 最新版本安装:参考官方安装指南
  • 其他发行版/系统:参考其他发行版指南
  • 文档仓库:更多细节可查看https://github.com/seek4science/seek-documentation

许可证

版权所有 © 2009-2023,曼彻斯特大学和HITS gGmbH,采用BSD 3-clause许可证。

关于FAIRDOM倡议

FAIRDOM-SEEK的开发和资助是FAIRDOM倡议的一部分,该倡议致力于推动科研数据的FAIR原则实施。更多信息请访问FAIRDOM。

联系方式与贡献

联系方式

  • 报告问题或提供建议:参考联系我们

贡献指南

  1. Fork仓库(https://github.com/seek4science/seek/fork%EF%BC%89
  2. 创建功能分支(git checkout -b my-new-feature)
  3. 提交更改(git commit -am 'Add some feature')
  4. 推送到分支(git push origin my-new-feature)
  5. 创建新的Pull Request

更多贡献细节请参考贡献文档。

更多信息

  • 官方网站:SEEK for Science
  • GitHub仓库:https://github.com/seek4science/seek

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 seek 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/fairdom/seek:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

DockerHub 原生拉取命令

docker pull fairdom/seek:<标签>

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