fasthep/fast-hep-docker

fast-hep-docker镜像说明

镜像概述

fast-hep-docker是基于Anaconda Python 3.7 Alpine的Docker镜像，集成了FAST-HEP全套软件栈，支持Docker、Singularity、Shifter等多种容器运行环境，旨在为粒子物理领域的科研人员提供快速、统一的数据分析环境。

核心功能

• 预装FAST-HEP完整软件栈，包含fast_carpenter等核心分析工具
• 支持通过x509代理访问UKDC网格资源
• 兼容CVMFS分布式文件系统
• 提供多容器平台（Docker/Singularity/Shifter）的运行支持

使用场景

• 粒子物理实验数据的处理与分析任务
• 科研团队快速部署标准化的FAST-HEP工作环境
• 网格计算资源（如NERSC集群）中的数据分析应用

配置说明

Docker使用示例

拉取镜像

bash
docker pull fasthep/fast-hep-docker

运行fast_carpenter分析

bash
docker run -v $PWD:/work -it fasthep/fast-hep-docker fast_carpenter <datasets.yml> <processing.yml>

进入容器Shell

bash
docker run -v $PWD:/work -it fasthep/fast-hep-docker /bin/sh -l

Singularity使用示例

准备x509代理（访问网格资源时需要）

bash
export X509_VOMS_DIR=/cvmfs/grid.cern.ch/etc/grid-security/vomsdir
export X509_CERT_DIR=/cvmfs/grid.cern.ch/etc/grid-security/certificates
export X509_USER_PROXY=$PWD/.x509_user_proxy
voms-proxy-init -voms <voms>

运行fast_carpenter分析

bash
singularity run --contain -B /cvmfs -B $PWD:/work docker://fasthep/fast-hep-docker fast_carpenter <datasets.yml> <processing.yml>

进入容器Shell

bash
singularity run --contain -B /cvmfs -B $PWD:/work docker://fasthep/fast-hep-docker /bin/sh -l

CVMFS镜像路径

最新版本的Singularity镜像可通过CVMFS访问：

/cvmfs/singularity.opensciencegrid.org/fasthep/fast-hep-docker\:version-0.2.0

Shifter使用示例（NERSC集群）

查看已有的镜像列表

bash
shifterimg images

拉取镜像（若不存在或过时）

bash
shifterimg -v pull docker:fasthep/fast-hep-docker:latest

进入容器Shell

bash
shifter --module=cvmfs --image=fasthep/fast-hep-docker:latest sh -l