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freesurfer/synthstrip
freesurfer
稳健、通用的颅骨剥离工具，适用于任何类型的脑部图像。
14 次收藏下载次数: 0状态：社区镜像维护者：freesurfer仓库类型：镜像最近更新：7 个月前
SynthStrip
SynthStrip是一款颅骨剥离工具，旨在从各种医学成像模态中提取大脑，涵盖不同对比度、分辨率和多样化的受试者群体。它利用深度学习策略，通过从分割图合成高度可变的训练图像，使模型能够跨采集协议泛化。有关SynthStrip及Docker镜像使用的详细信息，请访问synthstrip.io。
版本变更
- https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/9f94380e7b134a4dea660f60d412c4cb4dd34144/mri_synthstrip/Dockerfile.cpu
https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/9f94380e7b134a4dea660f60d412c4cb4dd34144/mri_synthstrip/Dockerfile.gpu
- 向Docker镜像中https://github.com/freesurfer/freesurfer/pull/1323
- 恢复归一化以避免https://github.com/freesurfer/freesurfer/issues/1343
- 控制和报告背景填充值
- https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/515249be7a1d66aaeb2cf8f38c7ab8055d9ef94e/mri_synthstrip/Dockerfile.cpu
https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/515249be7a1d66aaeb2cf8f38c7ab8055d9ef94e/mri_synthstrip/Dockerfile.gpu
- 引入https://github.com/freesurfer/freesurfer/pull/1299
- 从Ubuntu切换到https://github.com/freesurfer/freesurfer/pull/1299
- 添加控制CPU线程数的选项
- 设置自动化测试
- https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/9a9948b87d48159e65a84ec2a6b38b0589ee5d67/mri_synthstrip/Dockerfile
- 支持大边界
- 解决NumPy弃用警告
- 添加保存距离变换的选项
- https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/484e73c005257a6a7a8fdca74cfabc2092307a07/mri_synthstrip/Dockerfile
- 支持多帧图像
- 使用Docker时将输出文件保存为普通用户
- 避免仅为显示帮助文本而等待PyTorch加载
- https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/da9a398d4f862540dc69fe19e8fb1cdf9ac0ea88/mri_synthstrip/Dockerfile
- 修复https://github.com/freesurfer/freesurfer/issues/1060
- 从CentOS切换到Ubuntu基础镜像
- https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/4e00ee28b3ea142e2241fade2f906b1014e5f550/mri_synthstrip/Dockerfile
- 修复https://github.com/freesurfer/freesurfer/issues/1025
- https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/c9111c2f46aefce271d3b72d278676aa7743ca2d/mri_synthstrip/Dockerfile
- 修复https://github.com/freesurfer/freesurfer/issues/1015
- 添加用于预测无脑脊液脑掩模的模型
- https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/ee25303198a0f223fe63b3cf7313c58b8c2e4fcf/mri_synthstrip/Dockerfile
- 解决SciPy弃用警告
- 从freesurfer包切换到surfa包
- 未提供参数时打印帮助文本
- https://github.com/freesurfer/freesurfer/blob/b3f83c7a7ca0917b4e194b8b8738693a27122d5c/mri_synthstrip/Dockerfile
- 发布初始镜像
联系方式
请联系FreeSurfer邮件列表或https://github.com/freesurfer/freesurfer%E3%80%82
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 synthstrip 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/freesurfer/synthstrip:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull freesurfer/synthstrip:<标签>
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