gromacs/gmx-configurations

gromacs-docker-container-maker

镜像概述和主要用途

gromacs-docker-container-maker是用于构建Docker Hub上gromacs/gromacs仓库容器的工具，由gromacs-docker仓库构建。它通过不同的构建配置生成GROMACS容器，是gromacs/gromacs镜像构建流程的核心组成部分。

核心功能和特性

• 多版本支持：可构建不同版本的GROMACS
• 配置灵活性：支持修改构建配置，包括构建参数和可用配置类型
• 构建流程控制：通过build-all-dockerfiles.sh脚本控制构建配置，该脚本会多次调用build-dockerfiles.py处理不同配置
• Docker Hub集成：与Docker Hub的gromacs/gmx-configurations仓库集成，自动构建指定配置

使用场景和适用范围

适用于GROMACS开发者或维护人员，用于管理和更新Docker Hub上gromacs/gromacs镜像的构建流程，特别是需要构建不同配置的GROMACS容器时使用。

使用方法和配置说明

更新与构建流程

1. 修改构建配置或版本

   • 编辑build-dockerfiles.py以更改构建配置方式或指定的GROMACS版本
   • 如需调整构建配置列表，修改build-all-dockerfiles.sh（该脚本通过多次调用build-dockerfiles.py控制构建配置）

2. 生成Dockerfile 完成配置修改后，运行以下命令生成Dockerfile：

   bash
   ./build-all-dockerfiles.sh
   

3. 版本控制与推送

   • 创建新的git分支并推送到仓库：

     bash
     git checkout -b new-config-branch
     git push origin new-config-branch
     

   • Docker Hub的gromacs/gmx-configurations仓库会从该项目构建多个配置，添加新构建配置时需手动扩展此设置

4. 测试与合并

   • 手动测试配置（未来将支持基础自动化测试）
   • 当配置集测试通过后，向https://github.com/bioexcel/gromacs-docker-container-maker的master分支提交合并请求

5. 更新gromacs/gromacs镜像

   • 合并请求被接受后，对https://github.com/bioexcel/gromacs-docker进行相应修改，使其拉取新容器进行重建
   • 如无需修改，可直接从https://hub.docker.com/repository/docker/gromacs/gromacs/builds触发重建

维护者

Mark Abraham (github: mabraham)