hariszaf/darn

DARN - Dark mAtteR iNvestigator工具

镜像概述

DARN（Dark mAtteR iNvestigator）是一款生物信息学工具，通过COI参考生命树将输入序列分配到三个生命域，旨在提供样本中物种存在的概述，而非确定的分类学分配结果。

核心功能

• 基于COI参考生命树，将序列映射到细菌、古菌、真核生物三个生命域
• 输出样本中物种组成的概览信息
• 辅助用户快速了解序列数据的物种分布特征

使用场景

• 生物信息学研究中对序列数据的初步物种组成分析
• 环境样本、实验样本的物种分布探索
• 序列分类的前期辅助工具

配置说明

具体配置参数及使用方法请参考官方GitHub仓库：https://github.com/hariszaf/darn

部署示例

Docker Run命令

bash
docker run --rm -v $(pwd)/input:/input -v $(pwd)/output:/output hariszaf/darn [参数]

说明：将本地input目录挂载到容器内作为输入路径，output目录作为结果输出路径，替换[参数]为具体运行参数（如输入文件路径、输出格式等）。

Docker Compose示例（可选）

yaml
version: "3"
services:
  darn:
    image: hariszaf/darn
    volumes:
      - ./input:/input
      - ./output:/output
    command: [参数]

替换[参数]为实际运行所需的命令参数。