htcondor/htc-base-notebook

高吞吐量计算笔记本

本仓库包含CHTC高吞吐量计算笔记本（HTC Notebooks）的Dockerfile源码。每个笔记本基于https://jupyter-docker-stacks.readthedocs.io/en/latest/%E4%B8%AD%E7%9A%84%E4%B8%80%E4%B8%AA%E9%95%9C%E5%83%8F%EF%BC%8C%E9%95%9C%E5%83%8F%E5%90%8D%E7%A7%B0%E5%B7%B2%E6%98%8E%E7%A1%AE%E6%A0%87%E8%AF%86%E3%80%82

HTC笔记本镜像包含Jupyter Lab和可本地运行作业的“个人”HTCondor，非常适合在扩展到整个HTCondor池之前，在本地资源上测试工作流。同时，HTC笔记本也可配置为Jupyter Hub的一部分，连接到更大的HTCondor池。

更多关于这些镜像的通用使用信息（以及技巧），请参考https://jupyter-docker-stacks.readthedocs.io/en/latest/#table-of-contents%E6%96%87%E6%A1%A3%E3%80%82

快速开始

要从Docker Hub拉取并运行预构建的HTC笔记本镜像，请使用如下docker run命令：

console
$ docker run -it --rm -p 8888:8888 htcondor/htc-scipy-notebook:latest

将htc-scipy-notebook替换为你偏好的镜像栈（完整列表见下文），latest替换为你偏好的标签。latest标签始终指向该镜像栈的最新版本，但也提供https://hub.docker.com/r/htcondor/htc-scipy-notebook/tags%E3%80%82

若要将当前工作目录绑定挂载到容器中，请在docker run命令中添加--mount选项：

console
$ docker run -it --rm -p 8888:8888 --mount type=bind,source="$(pwd)",target=/home/jovyan/work htcondor/htc-scipy-notebook:latest

这会将启动容器的目录链接到容器内的/home/jovyan/work路径。容器内外的更改会相互同步。

如果不想自动运行Jupyter Lab，而是需要（例如）bash shell，请在docker run命令末尾添加bash：

console
$ docker run -it --rm -p 8888:8888 htcondor/htc-scipy-notebook:latest bash

可用镜像

以下是各镜像包含内容的简要概述。关于镜像中Jupyter部分的详细信息，请参见https://jupyter-docker-stacks.readthedocs.io/en/latest/using/selecting.html#core-stacks%E3%80%82

除文档中描述的内容外，每个镜像都包含一个运行中的“个人”HTCondor池，以及https://htcondor.readthedocs.io/en/latest/apis/python-bindings/index.html%E5%92%8Chttps://htmap.readthedocs.io/en/latest/%E3%80%82

• https://hub.docker.com/r/htcondor/htc-base-notebook - 最小的实用容器；通常是自定义镜像的最佳基础镜像。
• https://hub.docker.com/r/htcondor/htc-minimal-notebook - 在htc-base-notebook基础上添加了git、emacs、vim等实用命令行工具。
• https://hub.docker.com/r/htcondor/htc-scipy-notebook - 包含科学Python生态系统的流行包，如scipy和matplotlib。
• https://hub.docker.com/r/htcondor/htc-r-notebook - 包含R解释器和流行的tidyverse包。
• https://hub.docker.com/r/htcondor/htc-datascience-notebook - 包含htc-scipy-notebook和htc-r-notebook的所有内容，以及Julia。
• https://hub.docker.com/r/htcondor/htc-tensorflow-notebook - 包含htc-scipy-notebook的所有内容，加上Tensorflow和Keras。
• https://hub.docker.com/r/htcondor/htc-pyspark-notebook - 包含htc-scipy-notebook的所有内容，加上Apache Spark。
• https://hub.docker.com/r/htcondor/htc-all-spark-notebook - 包含htc-pyspark-notebook的所有内容，加上Apache Spark的R和Scala支持。

技巧与注意事项

如果使用绑定挂载从容器内访问本地文件，请勿直接挂载到/home/jovyan。应始终使用/home/jovyan的子目录，如/home/jovyan/work。（直接绑定挂载到/home/jovyan会破坏容器内运行的HTCondor池。）