imamiland/aaprop

AAProp — 氨基酸特性API

概述

AAProp是一个轻量级REST服务，提供20种标准氨基酸的基本生化特性。该服务设计简洁、响应快速，支持通过氨基酸名称、三字母代码或单字母代码进行查询，返回结构化JSON数据，便于集成到生物信息学管道或微服务架构中。

核心功能与特性

• 多方式查询：支持通过氨基酸名称、三字母代码或单字母代码检索信息
• 结构化数据返回：返回JSON格式数据，包含以下字段：
  • 全名（如“Alanine”）
  • 短名称/三字母代码（如“Ala”）
  • 单字母代码（如“A”）
  • 侧链分类（如“Nonpolar”）
  • 分子量（如89.09）
  • 密码子列表（如["GCT", "GCC", "GCA", "GCG"]）
• 轻量高效：资源占用低，响应速度快，适合作为生物信息学流程或微服务的组件

使用场景与适用范围

• 生物信息学工具与管道：需要集成氨基酸元数据的分析流程
• Web服务与微服务：作为独立服务提供氨基酸特性查询，避免硬编码常量
• 教学与研究项目：为学术研究或教学活动提供便捷的程序化氨基酸特性访问方式

使用方法与配置说明

公共API端点

公共服务实例可通过以下地址访问：
[***]

查询示例：
获取“Alanine”的特性数据：

bash
curl https://aaprop.shuttleapp.rs/amino_acid/Alanine

示例响应：

json
{
  "amino_acid": {
    "name": "Alanine",
    "short_name": "Ala",
    "abbreviation": "A",
    "side_chain": "Nonpolar",
    "molecular_weight": 89.09,
    "codons": ["GCT", "GCC", "GCA", "GCG"]
  }
}

Docker部署私有实例

拉取镜像

bash
docker pull imamiland/aaprop:latest

启动容器

bash
docker run -p 8000:8000 imamiland/aaprop:latest

本地访问

服务启动后，可通过以下地址查询本地实例：
http://localhost:8000/amino_acid/{标识符}

其中{标识符}可替换为氨基酸名称、三字母代码或单字母代码。

相关链接

• 源代码：https://github.com/AliSajid/aaprop
• 快速入门指南：AAProp Quick Start Guide
• 许可证：MIT OR Apache-2.0