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Intel优化的LAMMPS（大规模原子/分子并行模拟器）Docker镜像，基于Intel HPC Toolkit（ubuntu22.04）和LAMMPS 28Mar2023版本，用于高性能原子分子模拟。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：intel仓库类型：镜像最近更新：2 年前
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LAMMPS Docker镜像文档
概述
基于https://hub.docker.com/r/intel/hpckit%EF%BC%88ubuntu22.04%E7%89%88%E6%9C%AC%EF%BC%89%E5%92%8CLAMMPS%E5%8C%85%EF%BC%8828Mar2023%E7%89%88%E6%9C%AC%EF%BC%89%E6%9E%84%E5%BB%BA%E7%9A%84Stack%E9%95%9C%E5%83%8F%EF%BC%8C%E7%94%A8%E4%BA%8E%E8%BF%90%E8%A1%8CLAMMPS%EF%BC%88%E5%A4%A7%E8%A7%84%E6%A8%A1%E5%8E%9F%E5%AD%90/%E5%88%86%E5%AD%90%E5%B9%B6%E8%A1%8C%E6%A8%A1%E6%8B%9F%E5%99%A8%EF%BC%89%E3%80%82
核心功能与特性
- 集成Intel优化的LAMMPS版本，提供高性能原子分子模拟能力
- 支持多种预定义模拟模型，满足不同科研场景需求
- 通过环境变量灵活配置模拟参数，如线程数、进程数等
- 支持OpenMP和MPI并行计算，充分利用多核计算资源
系统要求
- 需支持Intel® AVX-512指令集
配置参数
可通过设置以下环境变量修改测试执行，未设置则使用默认值：
- LAMMPS_MODEL：要执行的模型。默认值：
in.intel.airebo。详见有效模型列表。 - OMP_NUM_THREADS：OpenMP线程数。默认值：
auto，自动检测并使用每插槽核心数。 - GATED：是否运行缩短版基准测试。默认运行完整版，设置为非空字符串则运行缩短版。
- USE_PPN：是否将PPN作为
mpiexec的参数。默认不使用，设置为非空字符串则启用。 - USE_LRT：是否将LRT作为LAMMPS二进制文件的参数。默认不使用，设置为非空字符串则启用。
- NUM_PROCESSES：MPI进程数。默认值：
auto，自动检测并使用每插槽核心数与插槽数的乘积。 - MULTIPLIER：用于缩放测试长度的乘数。此值会覆盖
GATED选项。
有效模型
- in.intel.airebo
- in.intel.dpd
- in.intel.eam
- in.intel.lc
- in.intel.lj
- in.intel.rhodo
- in.intel.sw
- in.intel.tersoff
- in.intel.water
使用方法
基本运行命令
bashdocker run -e LAMMPS_MODEL=in.intel.lj -e OMP_NUM_THREADS=4 intel/lammps-stack
自定义配置示例
运行缩短版测试，使用指定MPI进程数和线程数：
bashdocker run -e GATED=1 -e NUM_PROCESSES=8 -e OMP_NUM_THREADS=2 intel/lammps-stack
调整测试长度示例
使用乘数缩放测试长度（覆盖GATED选项）：
bashdocker run -e MULTIPLIER=2 -e LAMMPS_MODEL=in.intel.eam intel/lammps-stack
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 intel-optimized-lammps 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/intel/intel-optimized-lammps:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull intel/intel-optimized-lammps:<标签>
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oldzhang
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