lorenzobonaguro/cycondor
lorenzobonaguro
这是基于R生态系统cyCONDOR的Docker镜像，用于高维cytometry（HDC）数据的端到端分析，覆盖从预处理到生物解释的全流程，助力研究人员高效处理单细胞表型数据。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：lorenzobonaguro仓库类型：镜像最近更新：10 个月前
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cyCONDOR（HDC分析生态系统）
高维cytometry（HDC）是研究复杂系统中单细胞表型的强大工具。近年来技术普及但分析方法发展滞后，现有工具要么可扩展性有限，要么门槛过高，且缺乏统一的端到端分析生态。cyCONDOR作为易用框架，解决了这些痛点，覆盖全流程分析并支持深层数据解读。
核心功能
- 引导式数据预处理
- 聚类与降维分析
- 机器学习算法集成
- 伪时间分析与批次整合
- 端到端数据分析流程
使用场景
- 生物医学中单细胞表型研究
- 临床样本高维cytometry数据处理
- 跨组织/技术来源数据整合分析
- 从预处理到生物解释的全流程研究
配置说明
详细文档见https://lorenzobonaguro.github.io/cyCONDOR/
拉取镜像
bashdocker pull lorenzobonaguro/cycondor:v020
运行容器
bashdocker run -dp [你的端口]:8787 \ -e USER=[你的用户名] -e PASSWORD=[你的密码] \ --name condor_analysis \ -v [你的数据路径]:/home/[你的用户名]/data/ \ lorenzobonaguro/cycondor:v020
访问RStudio
本地访问：http://localhost:[你的端口]/
远程访问：http://[服务器IP/域名]:[你的端口]/
更多容器运行指南（如Singularity）见vignette：vignette("How_to_run_cyCONDOR_as_container")
有用链接
https://github.com/lorenzobonaguro/cyCONDOR
https://github.com/lorenzobonaguro/cyCONDOR_docker
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 cycondor 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/lorenzobonaguro/cycondor:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull lorenzobonaguro/cycondor:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
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oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"