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s_classify_pn_cells

mizjaggy18/s_classify_pn_cells

mizjaggy18

该镜像基于指定研究文献实现细胞分类功能,将Stardist输出的分割细胞图像分为阳性或阴性,需配合Cytomine Web-UI使用。

下载次数: 0状态:社区镜像维护者:mizjaggy18仓库类型:镜像最近更新:3 年前
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S_classify_PN_cells镜像说明

镜像概述

本镜像由WSHMunirah创建,用于细胞的阳性/阴性分类,基于研究文献(DOI: 10.1007/978-3-319-***-0_17)开发,需与Cytomine Web-UI协同使用。

核心功能

  • 处理Stardist输出的分割细胞图像数据
  • 将单个分割细胞(ROI)判定为阳性或阴性类别

使用场景

适用于生物医学领域的细胞图像分析场景,需在Cytomine Web-UI环境下运行,处理Stardist生成的细胞分割结果。

配置说明

  1. 需提前部署Cytomine Web-UI平台
  2. 输入数据要求为Stardist输出的分割细胞图像,每个ROI对应单个细胞
  3. 在Cytomine平台中配置该镜像作为分析工具,指定输入源为Stardist分割结果

部署示例

拉取镜像

bash
docker pull mizjaggy18/s_classify_pn_cells

平台配置

在Cytomine Web-UI中创建分析任务,选择该镜像并关联Stardist输出的细胞分割数据,启动分类任务即可。

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 s_classify_pn_cells 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/mizjaggy18/s_classify_pn_cells:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

DockerHub 原生拉取命令

docker pull mizjaggy18/s_classify_pn_cells:<标签>

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