mwatelescope/cotter

cotter镜像说明

cotter是André Offringa开发的MWA（默奇森广角阵列望远镜）数据预处理管道，用于对MWA观测数据进行预处理，为后续天文数据分析提供基础。

核心功能

• 处理MWA观测的gpubox文件和元数据文件
• 执行RFI（无线电频率干扰）标记，生成.mwaf格式的干扰标记文件
• 将预处理后的数据转换为.ms格式，支持后续天文数据分析

使用场景

适用于MWA望远镜观测数据的预处理阶段，帮助天文研究者清理干扰数据，获取高质量观测数据，支撑星系、脉冲星等天体物理研究。

配置说明

依赖项

使用cotter需安装以下开源依赖：

1. ERFA：可通过Debian系发行版的liberfa-dev包安装，或从源码编译。
2. LIBPAL：LIBSLA的开源替代库，依赖ERFA，需从源码编译并调整头文件路径。
3. aoflagger：可通过Debian系发行版的aoflagger-dev包安装，或从源码编译。

Docker部署示例

拉取官方镜像

bash
docker pull mwatelescope/cotter:latest

运行容器处理数据

假设主机数据目录为/path/to/host/data（含gpubox和metafits文件），映射到容器/data目录：

bash
docker run --name my_cotter --volume=/path/to/host/data:/data --rm=true mwatelescope/cotter:latest /bin/bash -c "cotter -allowmissing -initflag 4 -m /data/OBSID_metafits.fits -flagfiles /data/OBSID_%%.mwaf -o /data/OBSID.ms /data/*gpubox*.fits"

说明：

• OBSID替换为实际MWA观测ID
• --rm=true表示容器退出后自动删除（可按需调整）
• 命令执行RFI标记并生成.ms格式数据文件

自定义构建镜像

克隆仓库后使用自带Dockerfile构建：

bash
git clone https://github.com/mwatelescope/cotter.git
cd cotter
docker build -t cotter:custom .