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nanozoo/sourmash

nanozoo

基于sourmash vv2.0.1的Docker镜像，用于快速比较基因组序列，维护者Christian，许可证BSD-3-Clause public-domain，详细文档见Dockerwiki。

下载次数: 0状态：社区镜像维护者：nanozoo仓库类型：镜像最近更新：1 年前

镜像标签列表与下载命令

概述

sourmash是一款用于快速比较基因组、宏基因组及转录组序列的生物信息学工具，通过计算基因组哈希值（minhash sketches）实现高效序列相似性分析。本Docker镜像基于sourmash vv2.0.1版本构建，源码来源于官方GitHub仓库（https://github.com/dib-lab/sourmash%EF%BC%89%E3%80%82

维护者

Christian

Dockerwiki

详细文档可参考：version_control.html

许可证

采用BSD-3-Clause public-domain许可证，允许自由使用、修改和分发。

版本信息

镜像包含sourmash vv2.0.1版本。

Docker部署方案示例

拉取镜像（假设镜像名称为nanozoo/sourmash:vv2.0.1）： docker pull nanozoo/sourmash:vv2.0.1
运行容器并执行基础命令（如查看帮助）： docker run --rm nanozoo/sourmash:vv2.0.1 sourmash --help

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 sourmash 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/nanozoo/sourmash:<标签>

使用方法：

DockerHub 原生拉取命令

docker pull nanozoo/sourmash:<标签>

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