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neicnordic/sda-doa Docker 镜像 - 轩辕镜像

sda-doa
neicnordic/sda-doa
NeIC sda-doa Data Out API是一个数据输出接口服务,支持REST端点、TLS加密、RabbitMQ消息队列、PostgreSQL数据库集成,提供POSIX/S3文件存储的输出功能,支持JWT验证和Crypt4GH加密,用于处理数据导出请求。
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NeIC sda-doa Data Out API

镜像概述

NeIC sda-doa Data Out API是一个用于数据输出的接口服务,主要用于处理文件和数据集的导出请求。该服务集成了REST端点、TLS加密、消息队列(RabbitMQ)、数据库(PostgreSQL)和文件存储(POSIX/S3)等组件,支持JWT身份验证和Crypt4GH加密,提供安全可控的数据导出能力。

核心功能与特性

  • REST接口支持:提供可启用/禁用的REST端点,通过TLS加密保障数据传输安全
  • 消息队列集成:基于RabbitMQ处理导出请求队列,支持请求验证与异步处理
  • 多存储类型支持:提供POSIX文件系统或S3兼容对象存储作为输出存储(Outbox)
  • 数据库连接:集成PostgreSQL数据库,支持SSL模式保障数据交互安全
  • 安全验证机制:支持JWT(Passport/Visa令牌)验证和OpenID Connect用户认证
  • 数据加密支持:集成Crypt4GH加密标准,使用私钥和密码进行数据解密处理
  • 灵活日志配置:支持Logstash日志输出,可通过环境变量自定义不同组件的日志级别

使用场景与适用范围

适用于需要安全、可控数据导出功能的场景,包括:

  • 科研数据共享平台:安全导出研究数据至授权用户
  • 数据仓库系统:处理批量数据归档与外部导出请求
  • ***/敏感数据平台:通过加密和权限控制保障数据导出安全
  • 分布式数据处理系统:集成消息队列和存储服务实现异步数据输出

配置说明

环境变量配置

以下环境变量用于配置服务行为,可根据部署需求调整:

变量名默认值描述
REST_ENABLEDtrue启用/禁用REST端点
SSL_ENABLEDtrue启用/禁用REST端点TLS加密
KEYSTORE_PATH/etc/ega/ssl/server.cert服务器密钥库文件路径
KEYSTORE_PASSWORD密钥库密码(必填)
OUTBOX_ENABLEDtrue启用/禁用输出存储功能
OUTBOX_TYPEPOSIX输出存储类型:POSIX(文件系统)或S3(对象存储)
OUTBOX_QUEUEexportRequests文件/数据集导出请求的消息队列名称
OUTBOX_LOCATION/ega/outbox/p11-%s/files/输出存储路径(含用户名占位符%s)
BROKER_HOSTprivate-mqRabbitMQ消息队列主机名
BROKER_PORT5671RabbitMQ消息队列端口
BROKER_VHOST/RabbitMQ虚拟主机
BROKER_VALIDATEtrue是否验证RabbitMQ服务器证书
DB_INSTANCEdb数据库主机名
DB_PORT5432数据库端口
POSTGRES_DBlega数据库名称
SSL_MODEverify-full数据库连接SSL模式
ROOT_CERT_PATH/etc/ega/ssl/CA.cert数据库连接CA证书路径
CERT_PATH/etc/ega/ssl/client.cert数据库客户端证书路径
CERT_KEY/etc/ega/ssl/client.key数据库客户端密钥路径
POSTGRES_USERlega_out数据库用户名
POSTGRES_PASSWORD数据库密码(必填)
S3_ENDPOINTarchiveS3服务器主机名(OUTBOX_TYPE为S3时生效)
S3_PORT443S3服务器端口
S3_ACCESS_KEYminioS3访问密钥
S3_SECRET_KEYminiostorageS3密钥
S3_REGIONus-west-1S3区域
S3_BUCKETlegaS3存储桶名称
S3_SECUREtrue是否通过HTTPS访问S3后端
S3_ROOT_CERT_PATH/etc/ssl/certs/ca-certificates.crtS3连接CA证书路径
S3_OUT_ENDPOINToutboxS3输出存储服务器主机名
S3_OUT_PORT443S3输出存储服务器端口
S3_OUT_ACCESS_KEYminioS3输出存储访问密钥
S3_OUT_SECRET_KEYminiostorageS3输出存储密钥
S3_OUT_REGIONus-west-1S3输出存储区域
S3_OUT_BUCKETlegaS3输出存储桶名称
S3_OUT_SECUREtrue是否通过HTTPS访问S3输出存储后端
S3_OUT_ROOT_CERT_PATH/etc/ssl/certs/ca-certificates.crtS3输出存储连接CA证书路径
ARCHIVE_PATH/文件系统归档路径(OUTBOX_TYPE为POSIX时生效)
PASSPORT_PUBLIC_KEY_PATH/etc/ega/jwt/passport.pemPassport JWT验证公钥路径
OPENID_CONFIGURATION_URL[***]OpenID配置端点URL
USERINFO_ENDPOINT_URL[***]/userinfo端点URL(用于不透明令牌)
VISA_PUBLIC_KEY_PATH/etc/ega/jwt/visa.pemVisa JWT验证公钥路径
CRYPT4GH_PRIVATE_KEY_PATH/etc/ega/crypt4gh/key.pemCrypt4GH私钥路径
CRYPT4GH_PRIVATE_KEY_PASSWORD_PATH/etc/ega/crypt4gh/key.passCrypt4GH私钥密码路径
LOGSTASH_HOSTLogstash实例主机名(可选,为空则不启用)
LOGSTASH_PORTLogstash实例端口(可选,为空则不启用)
日志级别配置

可通过环境变量配置不同组件的日志级别,格式为LOGGING_LEVEL_<包名>(包名中的.需替换为_)。示例:

  • 禁用Spring框架日志:LOGGING_LEVEL_ORG_SPRINGFRAMEWORK=OFF
  • 设置DOA自身日志为DEBUG级别:LOGGING_LEVEL_NO_UIO_IFI=DEBUG

部署示例

Docker Swarm部署配置

以下是在Docker Swarm中部署sda-doa服务的示例配置:

yaml
...
  doa:
    image: neicnordic/sda-doa:latest
    ports:
      - 443:8080  # 映射容器8080端口到主机443端口(HTTPS服务)
    deploy:
      restart_policy:
        condition: on-failure  # 失败时自动重启
        delay: 5s             # 重启延迟时间
        window: 120s          # 稳定性观察窗口
    environment:
      - S3_PORT                # 引用外部定义的S3端口变量
      - KEYSTORE_PASSWORD=${SERVER_CERT_PASSWORD}  # 从环境变量注入密钥库密码
      - DB_INSTANCE=${DB_HOST}                     # 从环境变量注入数据库主机
      - POSTGRES_DB=${DB_DATABASE_NAME}            # 从环境变量注入数据库名称
      - POSTGRES_PASSWORD=${DB_LEGA_OUT_PASSWORD}  # 从环境变量注入数据库密码
      - S3_ACCESS_KEY=${MINIO_ACCESS_KEY}          # 从环境变量注入S3访问密钥
      - S3_SECRET_KEY=${MINIO_SECRET_KEY}          # 从环境变量注入S3密钥
      - LOGSTASH_HOST                              # 引用外部定义的Logstash主机
      - LOGSTASH_PORT                              # 引用外部定义的Logstash端口
    secrets:
      # 挂载证书和密钥文件(需预先创建Docker Secrets)
      - source: rootCA.pem
        target: /etc/ega/ssl/CA.cert               # 数据库CA证书
      - source: rootCA.pem
        target: /etc/ssl/certs/ca-certificates.crt # S3 CA证书
      - source: server.p12
        target: /etc/ega/ssl/server.cert           # 服务器密钥库
      - source: client.pem
        target: /etc/ega/ssl/client.cert           # 数据库客户端证书
      - source: client-key.der
        target: /etc/ega/ssl/client.key            # 数据库客户端密钥
      - source: jwt.pub.pem
        target: /etc/ega/jwt/passport.pem          # Passport JWT公钥
      - source: jwt.pub.pem
        target: /etc/ega/jwt/visa.pem              # Visa JWT公钥
      - source: ega.sec.pem
        target: /etc/ega/crypt4gh/key.pem          # Crypt4GH私钥
      - source: ega.sec.pass
        target: /etc/ega/crypt4gh/key.pass         # Crypt4GH私钥密码
...
配置说明
  • 端口映射:容器内8080端口映射到主机443端口,提供HTTPS服务
  • 重启策略:服务异常时自动重启,通过延迟和观察窗口确保服务稳定性
  • 环境变量管理:敏感信息(如密码、密钥)通过环境变量注入,避免配置文件硬编码
  • 安全文件挂载:证书和密钥文件通过Docker Secrets安全挂载,防止敏感信息泄露

部署前需确保所有引用的secrets(如rootCA.pem、server.p12等)已在Docker Swarm中创建。

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