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perseus-shareddb

ohdsi/perseus-shareddb

ohdsi

OHDSI Perseus共享数据库镜像,支持ETL配置设计与实现,将原生数据转换为OMOP通用数据模型,并提供词汇搜索、ETL文档生成、代码映射及数据质量检查功能。

下载次数: 0状态:社区镜像维护者:ohdsi仓库类型:镜像最近更新:3 年前
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OHDSI Perseus共享数据库镜像

镜像概述

OHDSI Perseus共享数据库是OHDSI Perseus工具的配套数据库组件,Perseus是一款基于Web的ETL(抽取、转换、加载)配置设计与实现工具,可将原生/原始***数据转换为OMOP通用数据模型(CDM),并集成标准化词汇搜索、ETL流程文档生成、代码映射及数据质量检查等功能。

核心功能

  • ETL配置设计与实现:支持原生数据向OMOP CDM的转换流程配置
  • 标准化词汇搜索:提供***领域标准化词汇的检索能力
  • ETL文档生成:自动生成ETL流程的详细文档,确保可追溯性
  • 代码映射:实现不同数据编码体系间的映射转换
  • 数据质量检查:内置工具验证转换后数据的质量合规性

使用场景

  • 数据标准化:将多来源原生数据转换为统一的OMOP CDM,支持跨机构数据共享与分析
  • ETL流程管理:规范ETL流程的设计与文档化,提升数据转换效率
  • ***数据质量管控:通过内置检查工具保障转换后数据的准确性与一致性

配置说明

具体配置需结合Perseus主工具使用,建议参考官方GitHub仓库获取详细配置指南。

Docker部署示例

bash
docker run -d --name perseus-shareddb -p 5432:5432 ohdsi/perseus-shareddb

官方资源

  • GitHub仓库:https://github.com/OHDSI/Perseus
  • 许可证:Apache License 2.0 ===END===

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 perseus-shareddb 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/ohdsi/perseus-shareddb:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

DockerHub 原生拉取命令

docker pull ohdsi/perseus-shareddb:<标签>

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