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PLINK官方Docker镜像，提供免费开源的全基因组关联分析工具集，支持VCF文件、dosage数据和pgen/pvar/psam格式，实现高效的大规模基因组数据分析，包括合并、过滤和关联测试等基础操作。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：openeuler仓库类型：镜像最近更新：24 天前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明
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PLINK Docker镜像文档
镜像概述和主要用途
本镜像为PLINK的官方Docker镜像，PLINK是一款免费开源的全基因组关联分析工具集，旨在以计算高效的方式执行一系列基础的大规模分析。该镜像由openEuler CloudNative SIG维护，适用于需要进行基因组数据处理和关联分析的科研场景。
核心功能和特性
- 原生数据支持：直接处理VCF文件和dosage数据
- 性能优化：基础操作（如合并、过滤、关联测试）性能显著提升
- 高效存储格式：支持pgen/pvar/psam格式，用于高效存储大规模基因组数据
- 功能完整性：除非连接合并外，大部分基础功能已实现
了解更多PLINK信息，请访问PLINK官方网站。
支持的标签和架构
PLINK Docker镜像的标签由PLINK版本和基础镜像版本组成，具体信息如下：
| 标签 | 当前版本 | 支持架构 |
|---|---|---|
| 2.0.0-a.7.1-oe2403sp3 | 基于openEuler 24.03-LTS-SP3的plink2 2.0.0-a.7.1 | amd64, arm64 |
使用方法和配置说明
前提条件
确保已安装Docker，或在Windows系统上使用适用于Linux容器的Docker。
获取镜像
可通过以下两种方式获取PLINK Docker镜像：
1. 从DockerHub拉取预构建镜像
bashdocker pull openeuler/plink:2.0.0-a.7.1-oe2403sp3
2. 从源码本地构建镜像
bashdocker build -t openeuler/plink:2.0.0-a.7.1-oe2403sp3 2.0.0-a.7.1/24.03-lts-sp3/
运行容器
启动PLINK环境容器：
bashdocker run -it openeuler/plink:2.0.0-a.7.1-oe2403sp3
验证安装
在容器内执行以下命令验证PLINK安装：
bashplink2 --version
问题反馈
如有任何问题或需要使用特定功能，请在openeuler-docker-images提交issue或pull request。
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull openeuler/plink:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"