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opengatecollaboration
OpenGATE协作组织的官方Docker镜像仓库，包含多个版本的GATE及配套科学计算工具（如Geant4、ROOT、CLHEP、ITK/RTK），基于不同Linux发行版，适用于医学成像模拟、辐射剂量计算等科学研究场景。
13 次收藏下载次数: 0状态：社区镜像维护者：opengatecollaboration仓库类型：镜像最近更新：1 年前
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GATE 官方Docker镜像文档
镜像概述
本仓库是OpenGATE协作组织（OpenGATE Collaboration）提供的官方Docker镜像，包含多个版本的GATE（Geant4 Application for Tomographic Emission）及相关科学计算工具。GATE是基于Geant4的开源模拟平台，广泛用于医学成像（如PET、SPECT、CT）和辐射剂量计算等领域。镜像针对集群部署优化，移除了可视化组件及构建文件，保持轻量级特性。
核心功能与特性
1. 多版本支持
提供从8.1到9.4.1的多个GATE版本，满足不同研究需求：
- 最新版本：9.4.1（标签
9.4.1-docker、latest） - 历史版本：9.4、9.3、9.2、9.1、9.0、8.2、8.1等
2. 预装依赖组件
每个版本均包含以下科学计算工具：
- CLHEP：高能物理计算库（版本随GATE变化，如2.4.6.0、2.4.5.1等）
- Geant4：粒子物理模拟工具包（版本适配GATE，如11.3.0、11.2.1等）
- ROOT：数据分析框架（版本如v6-24-06、v6-19-02等）
- ITK/RTK：医学图像处理库（大部分版本包含）
3. 基础操作系统
基于不同Linux发行版，确保兼容性：
- 新版本（9.2及以上）：Rocky Linux 8
- 旧版本（9.1及以下）：CentOS 8、CentOS 7.6、Ubuntu 18.04等
4. 优化特性
- 集群友好：Geant4和GATE以最小选项安装（无可视化组件），适合无头集群环境
- 轻量级设计：删除源代码和构建文件，仅保留运行时必需文件
适用场景
- 医学成像模拟（PET、SPECT、CT设备仿真）
- 辐射剂量计算与辐射防护研究
- 核医学与放射治疗学术研究
- 高性能计算集群中的批量模拟任务
镜像标签与版本信息
可用标签（Tags available）
| 标签 | 基础系统 | CLHEP版本 | Geant4版本 | ROOT版本 | ITK/RTK | GATE版本 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 9.4.1-docker, latest | rockylinux8 | 2.4.6.0 | 11.3.0 | v6-24-06 | 包含 | 9.4.1 |
| 9.4-docker | rockylinux8 | 2.4.6.0 | 11.2.1 | v6-24-06 | 包含 | 9.4 |
| 9.3-docker | rockylinux8 | 2.4.6.0 | 11.1.1 | v6-24-06 | 包含 | 9.3 |
| 9.2-docker | rockylinux8 | 2.4.5.1 | 11.0.0 | v6-24-06 | 包含 | 9.2 |
| 9.1-docker | Centos8 | 2.4.4.1 | 10.7.1 | v6-19-02 | 包含 | 9.1 |
| 9.0-docker | Centos8 | 2.4.1.3 | 10.6.1 | v6-19-02 | 包含 | 9.0 |
| 8.2-docker | Centos8 | 2.4.1.0 | 10.5.1 | v6-19-02 | 包含 | 8.2 |
| 8.1-docker | Centos8 | 2.3.3.2 | 10.4.2 | v6-19-02 | - | 8.1 |
旧镜像（Old images）
| 标签 | 基础系统 | Geant4版本 | ROOT版本 | ITK/RTK | GATE版本 |
|---|---|---|---|---|---|
| 9.0 | Ubuntu 18.04 | geant4.10.06.p01 | 6.14/06 | - | 9.0 |
| 8.2 | CentOS 7.6.1810 | geant4.10.05 | 6.14/06 | - | 8.2 |
| 8.2_RTK-ITK | CentOS 7.6.1810 | geant4.10.05 | 6.14/06 | 包含 | 8.2 |
| 8.1.p01 | CentOS 7-5.1804.4.el7.centos | geant4.10.04.p02 | 6.14/02 | - | 8.1.p01 |
| 8.1.p01_RTK-ITK | CentOS 7-5.1804.4.el7.centos | geant4.10.04.p02 | 6.14/02 | 包含 | 8.1.p01 |
使用方法
1. 获取镜像
拉取最新版本：
bashdocker pull opengatecollaboration/gate:latest
拉取特定版本（如9.4.1）：
bashdocker pull opengatecollaboration/gate:9.4.1-docker
2. 运行容器
交互模式启动并进入命令行：
bashdocker run -it opengatecollaboration/gate:latest /bin/bash
挂载本地数据目录（如模拟文件）：
bashdocker run -it -v /本地数据路径:/容器内路径 opengatecollaboration/gate:latest /bin/bash
3. 验证安装
容器内执行以下命令验证GATE安装：
bashgate --version
注意事项
- 无可视化支持：镜像未安装可视化组件，不支持图形界面操作
- 轻量级设计：仅保留运行时文件，删除了源代码和构建文件
- 版本兼容性：各版本依赖组件已适配对应GATE版本，建议使用官方推荐组合
第三方软件声明
本产品包含以下组织开发的软件：
- Geant4 Collaboration（[***]
- ROOT（[***]
- ITK（[***]
- RTK（[***]
- OpenGATE Collaboration（[***]
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 gate 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/opengatecollaboration/gate:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull opengatecollaboration/gate:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
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Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"