opengatecollaboration/gate

GATE 官方Docker镜像文档

镜像概述

本仓库是OpenGATE协作组织（OpenGATE Collaboration）提供的官方Docker镜像，包含多个版本的GATE（Geant4 Application for Tomographic Emission）及相关科学计算工具。GATE是基于Geant4的开源模拟平台，广泛用于医学成像（如PET、SPECT、CT）和辐射剂量计算等领域。镜像针对集群部署优化，移除了可视化组件及构建文件，保持轻量级特性。

核心功能与特性

1. 多版本支持

提供从8.1到9.4.1的多个GATE版本，满足不同研究需求：

• 最新版本：9.4.1（标签9.4.1-docker、latest）
• 历史版本：9.4、9.3、9.2、9.1、9.0、8.2、8.1等

2. 预装依赖组件

每个版本均包含以下科学计算工具：

• CLHEP：高能物理计算库（版本随GATE变化，如2.4.6.0、2.4.5.1等）
• Geant4：粒子物理模拟工具包（版本适配GATE，如11.3.0、11.2.1等）
• ROOT：数据分析框架（版本如v6-24-06、v6-19-02等）
• ITK/RTK：医学图像处理库（大部分版本包含）

3. 基础操作系统

基于不同Linux发行版，确保兼容性：

• 新版本（9.2及以上）：Rocky Linux 8
• 旧版本（9.1及以下）：CentOS 8、CentOS 7.6、Ubuntu 18.04等

4. 优化特性

• 集群友好：Geant4和GATE以最小选项安装（无可视化组件），适合无头集群环境
• 轻量级设计：删除源代码和构建文件，仅保留运行时必需文件

适用场景

• 医学成像模拟（PET、SPECT、CT设备仿真）
• 辐射剂量计算与辐射防护研究
• 核医学与放射治疗学术研究
• 高性能计算集群中的批量模拟任务

镜像标签与版本信息

可用标签（Tags available）

旧镜像（Old images）

使用方法

1. 获取镜像

拉取最新版本：

bash
docker pull opengatecollaboration/gate:latest

拉取特定版本（如9.4.1）：

bash
docker pull opengatecollaboration/gate:9.4.1-docker

2. 运行容器

交互模式启动并进入命令行：

bash
docker run -it opengatecollaboration/gate:latest /bin/bash

挂载本地数据目录（如模拟文件）：

bash
docker run -it -v /本地数据路径:/容器内路径 opengatecollaboration/gate:latest /bin/bash

3. 验证安装

容器内执行以下命令验证GATE安装：

bash
gate --version

注意事项

• 无可视化支持：镜像未安装可视化组件，不支持图形界面操作
• 轻量级设计：仅保留运行时文件，删除了源代码和构建文件
• 版本兼容性：各版本依赖组件已适配对应GATE版本，建议使用官方推荐组合

第三方软件声明

本产品包含以下组织开发的软件：

• Geant4 Collaboration（[***]
• ROOT（[***]
• ITK（[***]
• RTK（[***]
• OpenGATE Collaboration（[***]