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基于RockyLinux 9的OMERO.web Docker镜像,提供standalone(含插件与WhiteNoise,无需Nginx)和minimal两种版本,支持快速部署OMERO.web服务器,可通过环境变量配置连接OMERO.server及其他参数。
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OMERO.web Docker

基于RockyLinux 9的OMERO.web Docker镜像。另见SUPPORT.md

Standalone镜像:omero-web-standalone

获取运行中的OMERO.web服务器的最快方式是使用standalone镜像,该镜像使用WhiteNoise包,无需Nginx。此镜像还包含以下默认配置的OMERO.web插件:

  • figure
  • iviewer
  • mapr
  • parade

以下插件已安装但处于禁用状态:

  • fpbioimage
  • autotag
  • tagsearch

如需启用这些插件或修改默认插件的配置,请参阅相关插件文档。

运行命令示例

可通过定义OMEROHOST来设置要连接的单个OMERO.server:

docker run -d --name omero-web \
    -e OMEROHOST=omero.example.org \
    -p 4080:4080 \
    openmicroscopy/omero-web-standalone

也可使用环境变量设置所有配置选项,例如:

docker run -d --name omero-web \
    -e CONFIG_omero_web_server__list='[["omero.example.org", 4064, "omero"]]' \
    -e CONFIG_omero_web_debug=true \
    -p 4080:4080 \
    openmicroscopy/omero-web-standalone

Minimal OMERO.web镜像:omero-web

omero-web是最小化OMERO.web镜像,需要额外配置以提供Django静态文件。例如,可使用[***]

配置

所有OMERO配置属性可通过定义环境变量CONFIG_omero_property_name=来设置。由于变量名中不允许使用.,需将.替换为_,_替换为__。

可通过将文件挂载到/opt/omero/web/config/来提供额外的OMERO配置文件。以.omero结尾的文件将通过omero load加载。

更多配置细节请参见[***]

默认卷

  • /opt/omero/web/OMERO.web/var:OMERO.web的var目录,包含日志等。

暴露端口

  • 4080

开发

可使用此仓库构建自定义镜像,用于测试OMERO.web的开发版本。例如,从OMERO-build CI作业安装OMERO.web:

make VERSION=test REPO=test BUILDARGS="\
    --build-arg OMEGO_ADDITIONAL_ARGS=--ci=[***] \
    --build-arg=OMERO_VERSION=OMERO-build" docker-build

docker run -d --name test-web \
    -e CONFIG_omero_web_server__list='[["eel.openmicroscopy.org", 4064, "eel"]]' \
    -e CONFIG_omero_web_debug=true \
    -p 4080:4080 \
    test/omero-web-standalone:latest
查看更多 omero-web 相关镜像 →

常见问题

轩辕镜像免费版与专业版有什么区别?

免费版仅支持 Docker Hub 加速,不承诺可用性和速度;专业版支持更多镜像源,保证可用性和稳定速度,提供优先客服响应。

轩辕镜像免费版与专业版有分别支持哪些镜像?

免费版仅支持 docker.io;专业版支持 docker.io、gcr.io、ghcr.io、registry.k8s.io、nvcr.io、quay.io、mcr.microsoft.com、docker.elastic.co 等。

流量耗尽错误提示

当返回 402 Payment Required 错误时,表示流量已耗尽,需要充值流量包以恢复服务。

410 错误问题

通常由 Docker 版本过低导致,需要升级到 20.x 或更高版本以支持 V2 协议。

manifest unknown 错误

先检查 Docker 版本,版本过低则升级;版本正常则验证镜像信息是否正确。

镜像拉取成功后,如何去掉轩辕镜像域名前缀?

使用 docker tag 命令为镜像打上新标签,去掉域名前缀,使镜像名称更简洁。

查看全部问题→

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