rocker/rstudio-stable

Rocker版本稳定镜像系列

访问[***]

版本稳定的Rocker镜像

!rocker

https://github.com/rocker-org/geospatial%E3%80%81https://github.com/rocker-org/***der%E5%92%8Chttps://github.com/rocker-org/shiny%E4%B9%9F%E5%9F%BA%E4%BA%8E%E6%AD%A4%E6%A0%88%E6%9E%84%E5%BB%BA%EF%BC%8C%E9%81%B5%E5%BE%AA%E6%AD%A4%E5%A4%84%E6%8F%8F%E8%BF%B0%E7%9A%84%E7%9B%B8%E5%90%8C%E7%89%88%E6%9C%AC%E8%A7%84%E5%88%99%E3%80%82

本仓库提供了r-base、rocker/rstudio、rocker/hadleyverse系列的替代栈，重点强调可重现性。与这些镜像相比，本栈具有以下特点：

• 基于debian stable发行版构建（3.4.0版本前为debian:jessie，之后为debian:stretch），而非debian:testing，避免了debian:testing仓库更新导致的apt-get中断问题
• 通过源码安装固定版本的R，而非Debian已打包的版本（r-base栈从debian:unstable获取最新R二进制版本）
• 从指定日期的CRAN快照（MRAN仓库）安装所有R包
• 镜像通常比r-base系列更小

用户在需要高度可重现性时应使用版本标签，例如rocker/verse:3.3.1；使用默认latest标签（如rocker/verse）可获取最新的R包。所有镜像仍会接收Debian安全补丁更新。注意，这些镜像上的debian包（C库、编译器等）版本可能比r-base镜像系列中的更早。

注意事项

• 不要使用apt-get install r-cran-*在此栈上安装R包。版本稳定栈中的R版本和所有R包均通过源码安装。从apt安装R包（如r-cran-*包）会安装为stable debian发行版构建的R版本和包版本（如debian:stretch），导致出现第二个R版本和不同的包。请使用install.packages() R函数（或install2.r脚本）从源码安装R包，并仅使用apt安装必要的系统库（如libxml2）。如果希望通过apt-get从预构建二进制安装最新版本的包，请考虑使用r-base栈。

版本标签

使用R版本标签会锁定R版本，并锁定镜像上R包的安装日期。例如，rocker/tidyverse:3.3.1 Docker镜像将始终使用R 3.3.1和从2016-10-31 MRAN快照安装的R包，该日期对应该R版本作为最新版本的最后一天。而rocker/tidyverse:latest将始终包含最新的R版本和最新版本的R包。

主版本和次版本标签（如rocker/r-ver:3.4或rocker/verse:3）会指向最新的可用bugfix版本。上述关于R包版本的规则同样适用。例如，如果最新的bugfix版本是3.3.3和3.4.1，则rocker/{stack name}:3.3.3也会被标记为rocker/{stack name}:3.3，rocker/{stack name}:3.4.1会被标记为rocker/{stack name}:3.4和rocker/{stack name}:3。

详情参见VERSIONS.md。

镜像说明

rocker/r-ver镜像功能上相当于r-base，但略有精简。目前r-ver包含回溯至3.1.0的所有次要R版本的标签（只要MRAN的CRAN快照可用）；参见https://hub.docker.com/r/rocker/r-ver/tags%E3%80%82%E7%94%A8%E6%88%B7%E5%8F%AF%E5%B0%9D%E8%AF%95%E9%80%9A%E8%BF%87%E6%8C%87%E5%AE%9A%60--build-arg R_VERSION=从r-ver Dockerfile构建其他版本，不过对于非常旧的R版本可能无法正常工作。同样，所有非当前镜像会自动固定到该版本为当前版本最后一天的MRAN CRAN快照。用户可在构建r-ver镜像时使用--build-arg BUILD_DATE=`设置自定义快照日期。

rocker/tidyverse镜像功能上相当于rocker/hadleyverse，但移除了LaTeX部分（移至下游rocker/verse以保持tidyverse镜像更紧凑）。随着https://cran.r-project.org/web/packages/tidyverse/index.html%E7%9A%84%E5%87%BA%E7%8E%B0%EF%BC%8C%22hadleyverse%22%E4%B8%80%E8%AF%8D%E5%B7%B2%E9%80%90%E6%B8%90%E6%B7%98%E6%B1%B0%E3%80%82

rocker/rstudio镜像默认构建最新版本的RStudio。通过本地构建其Dockerfile时指定--build-arg RSTUDIO_VERSION=<VERSION>可自定义版本。注意： rocker/rstudio:latest是本栈中唯一已存在的镜像名称。为保持一致性，rocker/rstudio:latest现在基于r-ver:latest而非r-base:latest构建。

RStudio和运行时选项

有关设置密码、共享卷、添加RStudio Shiny Server(TM)和其他配置的文档，请参见https://github.com/rocker-org/rocker-versioned/blob/master/rstudio/README.md%E3%80%82

维护与更新

这些镜像处于积极维护中。这意味着虽然会努力保持镜像的一般功能，但Dockerfile和生成的镜像可能会随时间发生变化。具体而言：

• 当基础镜像更改时（从debian Docker镜像更改开始），镜像会定期在Docker Hub上重建。这大致相当于在debian上运行apt-get upgrade，因为所有apt-get命令会重新运行并拉取最新源。这使镜像能够接收从debian仓库安装的任何包的安全更新，但通常不会更改任何软件版本，且极不可能破坏任何功能。

• Dockerfile本身可能会更改，以提高性能、易用性、可读性或解决issues中提出的其他问题。这些更改不应改变镜像上R或R包的一般行为。这些更改可在git历史中查看。https://github.com/rocker-org/rocker-versioned%E4%BB%93%E5%BA%93%E5%B0%86%E4%BD%BF%E7%94%A8%E8%87%AA%E5%B7%B1%E7%9A%84%E8%AF%AD%E4%B9%89%E7%89%88%E6%9C%AC%E6%A0%87%E7%AD%BE%E6%9D%A5%E6%8C%87%E7%A4%BA%E5%AF%B9%E6%9C%AC%E4%BB%93%E5%BA%93%E7%9A%84%E6%9B%B4%E6%94%B9%EF%BC%8C%E8%BF%99%E4%BA%9B%E6%A0%87%E7%AD%BE%E7%9A%84%E5%BF%AB%E7%85%A7%E4%BC%9A%E5%9C%A8Zenodo%E4%B8%8A%E5%AD%98%E6%A1%A3%E3%80%82

许可协议

本仓库中的Dockerfile根据GPL 2或更高版本许可。

商标

RStudio是RStudio, Inc.的注册商标。通过https://registry.hub.docker.com/%E4%B8%8A%E6%89%98%E7%AE%A1%E7%9A%84%E9%95%9C%E5%83%8F%E4%BD%BF%E7%94%A8%E5%95%86%E6%A0%87%E6%9C%AF%E8%AF%ADRStudio%E5%92%8C%E5%88%86%E5%8F%91RStudio%E4%BA%8C%E8%BF%9B%E5%88%B6%E6%96%87%E4%BB%B6%E5%B7%B2%E8%8E%B7%E5%BE%97RStudio%E7%9A%84%E6%98%8E%E7%A1%AE%E8%AE%B8%E5%8F%AF%E3%80%82%E8%AF%B7%E6%9F%A5%E7%9C%8Bhttp://www.rstudio.com/about/trademark/%EF%BC%8C%E5%B9%B6%E5%B0%86%E5%85%B3%E4%BA%8E%E8%BF%9B%E4%B8%80%E6%AD%A5%E5%88%86%E5%8F%91%E6%88%96%E5%85%B6%E4%BB%96%E9%97%AE%E9%A2%98%E7%9A%84%E5%92%A8%E8%AF%A2%E5%8F%91%E9%80%81%E8%87%B3***%E3%80%82