romanhaa/cerebro
romanhaa
该Docker镜像提供Cerebro应用，用于单细胞RNA-seq数据的交互式可视化，包含全版本（带Seurat等分析R包）和轻量版本（仅应用），支持自定义端口与数据导出。
1 次收藏下载次数: 0状态：社区镜像维护者：romanhaa仓库类型：镜像最近更新：5 年前
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只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
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在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
Cerebro Docker镜像
镜像概述
本镜像封装了Cerebro应用（cerebroApp），专为单细胞RNA-seq数据的交互式可视化设计。镜像提供三个版本：
- 全版本：包含Cerebro应用及Seurat、Monocle等分析所需的R包和依赖；
- 轻量版本：仅包含Cerebro应用，无额外分析R包；
- Latest：指向最新的轻量版本。
核心功能
- 单细胞RNA-seq数据的交互式可视化展示；
- 全版本支持基于R包的数据分析（如细胞聚类、基因表达分析）；
- 支持数据导出到指定文件夹，方便结果保存与分享。
使用场景
适用于生物信息学研究人员、医学科研人员对单细胞RNA-seq数据进行可视化分析，助力理解细胞群体结构、基因表达模式及细胞类型鉴定等研究场景。
配置说明
- 通过
-p参数映射容器端口到主机端口； - 通过
-v参数挂载本地文件夹到容器内/plots路径，用于导出可视化结果。
部署示例
基础运行（默认8080端口）
bashdocker run -p <主机端口>:8080 -v <本地导出文件夹路径>:/plots docker.xuanyuan.run/romanhaa/cerebro
自定义端口运行
bashdocker run -p <自定义端口>:<自定义端口> -v <本地导出文件夹路径>:/plots docker.xuanyuan.run/romanhaa/cerebro Rscript -e 'shiny::runApp(cerebroApp::launchCerebro(), port=<自定义端口>, host="0.0.0.0", launch.browser=FALSE)'
更多信息
- cerebroApp官网：https://romanhaa.github.io/cerebroApp/
- Cerebro GitHub仓库：https://github.com/romanhaa/Cerebro
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
DockerHub 原生拉取命令
docker pull romanhaa/cerebro:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"