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Posit Package Manager Docker 镜像文档

快速参考

  • 维护者: Posit Docker 团队
  • 获取帮助: GitHub Issues 页面、Posit Package Manager 文档、Posit 社区论坛 或 Posit 支持
  • RStudio Package Manager 镜像: Docker Hub, GHCR

支持的标签及对应的 Dockerfile 链接

  • jammy, ubuntu2204, jammy-2025.04.2, ubuntu2204-2025.04.2

镜像概述和主要用途

Posit Package Manager(前身为 RStudio Package Manager)是一个仓库管理服务器,用于在团队、部门或整个组织中组织和集中管理 R 包。它提供 CRAN 的离线访问、自动化 CRAN 同步、共享本地包、限制包访问、跨仓库查找包等功能。为使用 R 的团队提供可靠且一致的包管理体验。

核心功能和特性

  • 集中管理 R 包,支持团队协作
  • 提供 CRAN 仓库的离线访问能力
  • 自动化 CRAN 同步,确保包版本一致性
  • 支持共享本地开发的 R 包
  • 可限制包访问权限,增强安全性
  • 跨多个仓库查找包的功能
  • 优化团队使用 R 的包管理流程

使用场景和适用范围

  • 企业或团队内部 R 包的集中管理
  • 需要离线环境访问 CRAN 包的场景
  • 希望标准化团队使用的 R 包版本的组织
  • 需要控制和审计 R 包使用的机构
  • 希望共享内部开发的 R 包的团队

支持注意事项

  1. 此镜像可能引入破坏性变更,因此我们建议:

    • 避免使用 {操作系统} 标签,以避免意外的版本变更
    • 更新前务必阅读 NEWS 以了解变更内容
  2. 过时的镜像将随着产品版本更新定期从 DockerHub 中移除。请计划定期更新或使用自己构建的镜像。

  3. 这些镜像旨在作为满足您需求的起点。建议创建此仓库的分支,以便在合并我们所做更改的同时,进行自己的安全扫描、使用基础操作系统或其他自定义更改。我们提供了构建说明用于这些情况。

  4. Package Manager 镜像默认使用此处文档中所述的 No Sandbox 选项,如果您需要为与 Git 相关的包构建配置更安全的选项,我们建议使用启用了沙箱的系统。

  5. 安全注意: 这些镜像是基于产品版本发布/更新时的构建环境按原样提供的。在生产使用前应进行审查和更新。如果您的组织对 CVE/漏洞严重性级别有特定的安全要求,您应计划使用构建说明克隆此仓库,并根据您特定的内部安全标准重建这些镜像。

使用方法和配置说明

基本使用示例

以下是使用产品许可证密钥在 Docker 中本地运行 Package Manager 的简单示例:

# 替换为有效的许可证
export RSPM_LICENSE=XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX

# 不使用持久化数据并使用默认配置运行
docker run -it \
    -p 4242:4242 \
    -e RSPM_LICENSE=$RSPM_LICENSE \
    rstudio/rstudio-package-manager:ubuntu2204

打开 http://localhost:4242 访问 Posit Package Manager UI。

概述

运行 Posit Package Manager Docker 镜像需要有效的 Posit Package Manager 许可证。

此容器包含:

  1. 两个版本的 R
  2. 两个版本的 Python
  3. Posit Package Manager

注意:Package Manager 目前对 R 版本不是很挑剔。很少需要更改 R 版本。

配置

Posit Package Manager 通过 /etc/rstudio-pm/rstudio-pm.gcfg 文件进行配置。您应该将此文件作为卷从主机挂载。重启容器后更改将生效。

确保配置文件已配置 HTTP.Listen 字段。完整的示例配置文件可在 package-manager/rstudio-pm.gcfg 查看。

持久化数据

为了在容器重启之间持久化 Package Manager 数据,需将 Server.DataDir 选项配置为指向持久卷。包含的配置文件期望主机机器或 Docker 编排系统提供的持久卷在 /var/lib/rstudio-pm 可用。如果您希望将其移动到不同的路径,可以更改 Server.DataDir 选项。

[Server]
DataDir = /mnt/rspm/data

产品许可

使用容器需要有效的 Posit Package Manager 许可证。您可以通过三种不同方式设置许可证:

  1. 在容器内将 RSPM_LICENSE 环境变量设置为有效的许可证密钥
  2. 在容器内将 RSPM_LICENSE_SERVER 环境变量设置为有效的许可证服务器/端口
  3. 将许可证文件挂载到 /var/lib/rstudio-pm/*.lic 或使用 RSPM_LICENSE_FILE_PATH 指定的其他路径

注意: 离线安装需要使用浮动许可证服务器、许可证文件或手动干预激活实例的自定义镜像。

使用许可证文件的示例

容器将自动在 /var/lib/rstudio-pm/*.lic 或 /home/rstudio-pm/.rstudio-pm/*.lic 查找许可证文件,如果存在,将尝试使用它进行激活。此示例使用绑定挂载从主机提供许可证文件。

docker run -it --privileged \
    -p 4242:4242 \
    --mount type=bind,ro,src=<许可证文件路径>,dst=/var/lib/rstudio-pm/rstudio-pm.lic \
    rstudio/rstudio-package-manager:ubuntu2204

或者,可以使用 RSPM_LICENSE_FILE_PATH 环境变量提供容器中许可证文件的路径。如果提供,容器将尝试从给定路径查找并激活许可证。

docker run -it --privileged \
    -p 4242:4242 \
    -e RSPM_LICENSE_FILE_PATH=/opt/license.lic \
    --mount type=bind,ro,src=<许可证文件路径>,dst=/opt/license.lic \
    rstudio/rstudio-package-manager:ubuntu2204

如果许可证文件未能成功激活,容器在大多数情况下将无法启动。您仍然可以通过对 license-manager 二进制文件运行 status 命令来验证容器的许可状态。

根据提供许可证文件的方式,License-File 字段可能是 /var/lib/rstudio-pm/*.lic 或 /home/rstudio-pm/.rstudio-pm/*.lic。只要 Status 字段显示 Activated,任一路径都应该有效。

$ docker exec -it <容器名称> /opt/rstudio-pm/bin/license-manager status
TTY detected. Printing informational message about logging configuration. Logging configuration loaded from '/etc/rstudio/logging.conf'. Logging to '/var/log/rstudio/rstudio-server/license-manager.log'.
RStudio License Manager 2024.04.2+764.pro1

-- License file status --

Status: Activated
Product-Key: XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX
Has-Key: Yes
Has-Trial: No
Tier: Tier Name
SKU-Year: 2024
Enable-Launcher: 1
Users: 0
User-Activity-Days: 365
Shiny-Users: 0
Allow-APIs: 1
Anonymous-Servers: 0
Unrestricted-Servers: 0
Licensee: Company Name
License-File: /home/rstudio-pm/.rstudio-pm/rstudio-pm.lic
Expiration: YYYY-MM-DD HH:mm:ss
Days-Left: XXX
License-Engine: 1.0.0.0
License-Scope: System

-- Local license status --

Trial-Type: Verified
Status: Expired
Has-Key: No
Has-Trial: Yes
License-Scope: System
License-Engine: 4.4.3.0

-- Floating license status --

License server not in use.
使用许可证密钥的示例

也可以通过设置 RSPM_LICENSE 环境变量使用许可证密钥激活容器。

# 替换为有效的许可证
export RSPM_LICENSE=XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX

# 不使用持久化数据并使用外部配置运行
docker run -it --privileged \
    -p 4242:4242 \
    -e RSPM_LICENSE=$RSPM_LICENSE \
    rstudio/rstudio-package-manager:ubuntu2204

如果可能,生产环境应避免使用许可证密钥激活,而应使用许可证文件,因为当容器未正常停止时,存在许可证激活泄露的风险。有关许可证密钥问题的更多详细信息,请参见下面的容器中产品许可的注意事项部分。

环境变量

变量名描述默认值
RSPM_LICENSEPosit Package Manager 的许可证密钥,格式应为:XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX无
RSPM_LICENSE_SERVER浮动许可证服务器,格式应为:my.url.com:port无

端口

变量描述
4242Posit Package Manager 的默认 HTTP 端口

详细使用示例

基本配置示例

# 替换为有效的许可证
export RSPM_LICENSE=XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX

# 不使用持久化数据并使用外部配置运行
docker run -it \
    -p 4242:4242 \
    -v $PWD/package-manager/rstudio-pm.gcfg:/etc/rstudio-pm/rstudio-pm.gcfg \
    -e RSPM_LICENSE=$RSPM_LICENSE \
    rstudio/rstudio-package-manager:ubuntu2204

带持久化数据的示例

# 替换为有效的许可证
export RSPM_LICENSE=XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX

# 使用持久化数据和外部配置运行
docker run -it \
    -p 4242:4242 \
    -v $PWD/data/rspm:/var/lib/rstudio-pm \
    -v $PWD/package-manager/rstudio-pm.gcfg:/etc/rstudio-pm/rstudio-pm.gcfg \
    -e RSPM_LICENSE=$RSPM_LICENSE \
    rstudio/rstudio-package-manager:ubuntu2204

打开 http://localhost:4242 访问 Posit Package Manager UI。

添加本地包到仓库的示例

要创建仓库,您需要直接访问容器并执行一些命令。为此,请使用 docker ps 找到 RSPM 的容器 ID 并运行:

docker exec -it {container-id} /bin/bash

以下是添加本地包的完整示例:

  1. 在主机系统上创建包 tarball,例如 data/pwb/rstudio/demo1_0.1.0.tar.gz

  2. 使用 docker cp 将 tarball 复制到容器的 /tmp 目录:

# 查找运行中的 package-manager 容器的容器 ID
docker ps

# 替换 b8ae944b7f2d 为您的容器 ID
docker cp data/pwb/rstudio/demo1_0.1.0.tar.gz b8ae944b7f2d:/tmp
  1. 在容器内创建仓库并添加包:
root@1b6f4f5fc669:/# rspm create source --name=demopkgs
Source 'demopkgs':
  Type:  Local
  
root@1b6f4f5fc669:/# rspm add --source=demopkgs --path='/tmp/demo1_0.1.0.tar.gz'
Added package '/tmp/demo1_0.1.0.tar.gz'.

root@1b6f4f5fc669:/# rspm create repo --name=demopkgs --description="demo package repo"
Repository: demopkgs - demo package repo - R

root@1b6f4f5fc669:/# rspm subscribe --repo=demopkgs --source=demopkgs
Repository: demopkgs
Sources:
--demopkgs (Local)
  1. 然后可以从本地机器上的 R 安装该包:
> install.packages("demo1", repos = "http://localhost:4242/demopkgs/latest")
Installing package into ‘/home/rstudio/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'http://localhost:4242/demopkgs/latest/src/contrib/demo1_0.1.0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 859 bytes
==================================================
downloaded 859 bytes

* installing *source* package ‘demo1’ ...
** using staged installation
** R
** byte-compile and prepare package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices
** testing if installed package can be loaded from temporary location
** testing if installed package can be loaded from final location
** testing if installed package keeps a record of temporary installation path
* DONE (demo1)

The downloaded source packages are in
  ‘/tmp/RtmpRVTKFG/downloaded_packages’

Docker Compose 配置示例

创建 docker-compose.yml 文件:

version: '3.8'

services:
  rspm:
    image: rstudio/rstudio-package-manager:ubuntu2204
    container_name: rspm
    restart: unless-stopped
    ports:
      - "4242:4242"
    environment:
      - RSPM_LICENSE=XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX-XXXX
    volumes:
      - ./package-manager/rstudio-pm.gcfg:/etc/rstudio-pm/rstudio-pm.gcfg
      - rspm_data:/var/lib/rstudio-pm
    stop_grace_period: 2m

volumes:
  rspm_data:

使用以下命令启动服务:

docker-compose up -d

容器中产品许可的注意事项

注意:本节不适用于使用许可证文件的激活。

当前在容器中使用我们的产品存在一个已知的许可问题。如果容器未被正常停止,许可证停用步骤可能会失败或被跳过。未能停用许可证可能导致"许可证泄露",即产品激活被耗尽,且无法使用传统方法停用,因为容器中的激活状态已丢失。

为避免"泄露"许可证,我们建议用户不要强制终止容器,并对 docker run 和 docker stop 命令分别使用 --stop-timeout 120 和 --time 120。这有助于确保停用脚本有足够的时间正常运行。

在某些情况下,可能难以或无法避免硬终止(例如,电源故障、主机上的严重错误)。不幸的是,这些情况中的任何一种都可能导致许可证泄露激活。为了帮助防止这些情况下的许可证泄露,用户可以将以下目录挂载到持久存储,以在容器重启时保留许可证状态数据。这些目录因产品而异。

  • 许可证密钥
    • /home/rstudio-pm/.local
    • /home/rstudio-pm/.prof
    • /home/rstudio-pm/.rstudio-pm
  • 浮动许可证
    • /home/rstudio-pm/.TurboFloat

请注意,这些目录中创建的文件是硬件锁定的,不能在主机之间传输。由于硬件指纹算法的特性,对主机或容器的任何低级更改都可能导致现有许可证状态文件失效。为避免此问题,我们建议在更改主机上的任何硬件或固件(例如,升级网卡或更新 BIOS)或容器(例如,更改使用的网络驱动程序或分配的 CPU 核心数)之前,优雅地关闭产品容器并允许其停用。

虽然保留许可证状态数据可以帮助避免重启时的许可证泄露,但这并不能保证。如果您在许可证方面遇到问题,请随时联系 Posit 支持。

虽然这些解决方案都不能完全消除问题,但它们应该有助于缓解问题。我们仍

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