sahuno/claude_gemini_container Docker Image Overview | Claude_gemini_container

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sahuno/claude_gemini_container

sahuno

1 次收藏下载次数: 0状态：社区镜像维护者：sahuno仓库类型：镜像最近更新：5 天前

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Claude & Gemini Container

Containerized AI coding assistants (Claude Code, Gemini CLI, OpenAI Codex) with bioinformatics workflow tools (Snakemake, Nextflow, nf-core). Multi-arch: amd64 + arm64.

Current Versions (Updated: March 2026)

Tool	Version	Description
Claude Code	2.1.77	Anthropic's AI coding CLI
Gemini CLI	0.33.2	Google's Gemini AI CLI
OpenAI Codex	0.115.0	OpenAI's Codex CLI
Snakemake	9.17.2	Workflow management system
nf-core	3.5.2	Community curated Nextflow pipelines

Versions are auto-updated daily by CI — see CI / Automation.

Quick Start

bash
# Pull
docker pull sahuno/claude_gemini_container:latest

# Run interactive with API keys and a workspace mount
docker run -it --rm \
  -e ANTHROPIC_API_KEY=your_key \
  -e GEMINI_API_KEY=your_key \
  -e OPENAI_API_KEY=your_key \
  -v $(pwd):/workspace \
  sahuno/claude_gemini_container:latest

# Show installed tool versions
docker run --rm sahuno/claude_gemini_container:latest container-info

What's Included

AI CLI tools — Claude Code, Gemini CLI, OpenAI Codex
Workflow management — Snakemake (with SLURM executor plugin), Nextflow, nf-core
Python 3 scientific stack — numpy, pandas, matplotlib, seaborn, plotly, scipy, scikit-learn, jupyter
Container runtime — Apptainer 1.4.0 (amd64 only, for HPC compatibility)
Java — OpenJDK 17 (required by Nextflow)
Dev tools — GitHub CLI (gh), git, git-lfs, vim, nano, curl, wget, rsync, jq, tree

Singularity / Apptainer (HPC)

bash
# Pull from Docker Hub (simplest method)
singularity pull docker://sahuno/claude_gemini_container:latest

# Run with bind mounts
export ANTHROPIC_API_KEY=your_key
singularity exec --bind /data:/data claude_gemini_container_latest.sif claude
singularity exec --bind /data:/data claude_gemini_container_latest.sif snakemake --version

CI / Automation

Two GitHub Actions workflows maintain this image:

Workflow	Trigger	What it does
`check-versions.yml`	Daily at 17:00 UTC + manual	Checks npm/PyPI for new versions of all 5 tools; opens a PR if any changed
`docker-build.yml`	Push to `main` + PR (validate only)	Runs smoke tests and Trivy security scan, then builds multi-arch and pushes to Docker Hub

Image tags pushed on each deploy:

:latest — always the newest build
:claude-X.Y.Z — pinned to the Claude Code version
:YYYYMMDD — date-pinned for reproducible pulls

A GitHub Release is created for every deploy with pinned pull commands.

Environment Variables

bash
export ANTHROPIC_API_KEY=your_key   # Claude Code
export GEMINI_API_KEY=your_key      # Gemini CLI
export OPENAI_API_KEY=your_key      # OpenAI Codex

Required Secrets (GitHub Actions)

Secret	Used by
`DOCKER_USERNAME`	Docker Hub login
`DOCKERHUB_TOKEN`	Docker Hub push + description sync

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