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schaff
自动构建
Virtual Cell（VCell）的REST API镜像，提供计算细胞生物学建模与模拟框架的服务支持，涵盖生化网络、电生理学等多种模拟能力，助力细胞生物学研究与分析。
下载次数: 0状态：自动构建维护者：schaff仓库类型：镜像最近更新：7 年前
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只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
https://xuanyuan.cloud/agents.md
在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
VCell API镜像 - 计算细胞生物学建模与模拟框架服务
VCell是一个全面的计算细胞生物学建模与模拟框架，支持从生物通路到细胞生物物理层面的研究。本镜像为VCell系统的REST API组件，用于支撑服务器端核心功能，包括模型数据库管理、集群计算调度等。
核心功能
- 提供RESTful API接口，支持细胞模型数据的存储、查询与管理
- 对接集群计算资源，实现模拟任务的分发与执行调度
- 协同VCell客户端、数据库及求解器组件，构建完整的建模与模拟生态
使用场景
- 细胞生物学研究人员通过API调用VCell的模拟能力，开展生化网络、电生理学等领域的实验
- 科研机构部署VCell服务器集群时，作为API服务节点提供核心接口支持
- 集成到生物信息学工作流中，实现自动化的细胞模型模拟与结果分析
配置说明
依赖环境
- Linux系统
- Docker（Swarm模式）
- PostgreSQL/Oracle数据库
- SLURM批处理调度服务
- Singularity（用于模拟求解器运行）
部署示例
构建VCell项目（含API组件）
bash# 克隆源码 git clone https://github.com/virtualcell/vcell cd vcell # 编译构建 mvn clean install dependency:copy-dependencies
部署VCell服务集群
参考镜像文档中的Docker Swarm配置指南，通过docker-compose.yml部署服务：
bash# 进入Swarm配置目录 cd docker/swarm # 自定义serverconfig.sh（参考serverconfig-uch.sh模板） # 部署服务栈 docker stack deploy -c docker-compose.yml vcell_cluster
许可证
VCell软件采用MIT开源许可证授权，允许自由使用、修改及分发。
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 vcell-api 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/schaff/vcell-api:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull schaff/vcell-api:<标签>
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"