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Specify的示例附件服务器实现,适用于Ubuntu系统,稍作修改可在其他Linux系统运行,Windows需大量适配。
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Web Asset Server

镜像概述和主要用途

Web Asset Server 是 Specify 的附件服务器实现,用于处理 Specify 系统的附件存储、管理及相关服务。该实现主要面向 Ubuntu 系统,其他 Linux 系统需少量修改即可运行,Windows 系统需大量适配才能使用。其核心功能包括附件的元数据处理、缩略图生成、Web 服务提供等,旨在为 Specify 客户端提供统一的附件访问接口。

核心功能和特性

  • 多版本 Python 支持:原生支持 Python 3.6,通过修改可适配 Python 2.6/2.7
  • 元数据处理:集成 ExifRead 库,支持读取附件的 EXIF 元数据
  • Web 服务框架:基于 bottlepy 轻量级 Web 框架构建
  • 缩略图生成:通过 ImageMagick 生成图片缩略图,Ghostscript 处理 PDF 缩略图
  • 部署灵活性:支持 Paste Python Web 服务器,可通过 upstart 或 systemd 实现服务自动启停
  • 安全访问控制:通过 Specify 全局偏好配置实现附件访问授权

使用场景和适用范围

  • 适用对象:Specify Collections Consortium 成员机构及使用 Specify 系统的用户
  • 应用场景:Specify 系统的附件集中管理,包括图片、PDF 等文件的存储、元数据提取和缩略图服务
  • 运行环境:优先推荐 Ubuntu 系统,其他 Linux 系统需调整依赖安装命令,Windows 系统不建议使用

详细使用方法和配置说明

系统依赖安装

依赖组件列表

  1. Python 3.6(Python 2.6/2.7 需适配)
  2. ExifRead(EXIF 元数据处理)
  3. sh(Python shell 命令工具)
  4. bottlepy(Web 微框架)
  5. ImageMagick(缩略图生成)
  6. Ghostscript(PDF 缩略图处理)
  7. Paste(Python Web 服务器)

Ubuntu 系统依赖安装命令

sudo apt-get -y install --no-install-recommends \
  python-pip \
  imagemagick \
  ghostscript
sudo pip install -r requirements.txt

源码仓库克隆

git clone git://github.com/specify/web-asset-server.git
cd web-asset-server

配置文件调整

修改工作目录下的 settings.py 文件,关键配置项包括:

  • SERVER:设置为 'paste'(推荐使用 Paste 服务器)
  • attachment.key:生成或获取访问密钥(需与 Specify 配置一致)

部署方式

Docker 部署(推荐)

Dockerfile
FROM ubuntu:latest
WORKDIR /app
RUN apt-get update && apt-get install -y --no-install-recommends \
    python3 \
    python3-pip \
    imagemagick \
    ghostscript \
    && rm -rf /var/lib/apt/lists/*
COPY requirements.txt .
RUN pip3 install --no-cache-dir -r requirements.txt
COPY . .
RUN sed -i 's/SERVER = .*/SERVER = "paste"/' settings.py
EXPOSE 8080
CMD ["python3", "server.py"]
docker-compose.yml
version: '3'
services:
  web-asset-server:
    build: .
    ports:
      - "8080:8080"
    volumes:
      - ./settings.py:/app/settings.py
      - ./assets:/app/assets  # 附件存储目录(可选)
    restart: always
启动命令
docker-compose up -d

传统部署(系统服务)

使用 Paste 服务器

在 settings.py 中设置 SERVER = 'paste',通过以下命令启动:

python server.py
特权端口访问(如 80 端口)

推荐使用 authbind 工具:

sudo apt-get install authbind
# 允许当前用户使用 80 端口
touch 80 && chmod u+x 80 && sudo mv 80 /etc/authbind/byport
# 启动命令
authbind python server.py

systemd 服务部署

  1. 创建服务文件 /etc/systemd/system/web-asset-server.service:
[Unit]
Description=Specify Web Asset Server
Wants=network.target

[Service]
User=specify  # 替换为实际运行用户
WorkingDirectory=/home/specify/web-asset-server  # 替换为实际路径
ExecStart=/usr/bin/authbind /usr/bin/python /home/specify/web-asset-server/server.py  # 若使用特权端口
Restart=always

[Install]
WantedBy=multi-user.target
  1. 启用并启动服务:
sudo systemctl daemon-reload
sudo systemctl enable --now web-asset-server

upstart 服务部署

  1. 创建配置文件 /etc/init/web-asset-server.conf:
description "Specify Web Asset Server"
author "Ben Anhalt <***>"

start on runlevel [234]
stop on runlevel [0156]

setuid anhalt  # 替换为实际运行用户

chdir /home/anhalt/web-asset-server  # 替换为实际路径
exec /usr/bin/authbind /usr/bin/python /home/anhalt/web-asset-server/server.py  # 若使用特权端口
respawn
  1. 启动服务:
sudo initctl reload-configuration
sudo start web-asset-server

日志路径:/var/log/upstart/web-asset-server.log

HTTPS 配置

若 Specify 7 服务器启用 HTTPS,需为 Web Asset Server 配置 HTTPS。推荐通过 Nginx 反向代理实现,配置示例参考 该 Gist。关键配置包括:

  • 代理转发至 Web Asset Server 服务端口
  • 重写 web_asset_store.xml 资源中的链接

Specify 系统配置

需在 Specify 全局偏好中添加以下属性(通过 Specify 客户端的“帮助 > 关于”菜单,双击“系统信息”中的机构名称进入配置界面):

属性名值说明
USE_GLOBAL_PREFS设置为 true,启用全局偏好
attachment.key与 settings.py 中的密钥一致
attachment.url服务器访问地址,格式:http://[服务器IP或域名]/web_asset_store.xml
attachment.use_path设置为 false,使用 URL 访问而非本地路径

Python 旧版本兼容性

  • Python 2.7 支持:使用 Python 2.7 分支仓库
  • Python 2.6 支持:参考 Python 2.6 兼容性说明

版权信息

Web Asset Server 版权所有 © 2020 Specify Collections Consortium。
本软件为自由软件,遵循 GNU General Public License 2 (GPL2) 协议,不提供任何明示或暗示的担保。

Specify Collections Consortium
Biodiversity Institute
University of Kansas
1345 Jayhawk Blvd.
Lawrence, KS 66045 USA
官网:[***]

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Specify 7基础Web服务,用于与其他Specify组件组合。
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常见问题

轩辕镜像免费版与专业版有什么区别?

免费版仅支持 Docker Hub 加速,不承诺可用性和速度;专业版支持更多镜像源,保证可用性和稳定速度,提供优先客服响应。

轩辕镜像免费版与专业版有分别支持哪些镜像?

免费版仅支持 docker.io;专业版支持 docker.io、gcr.io、ghcr.io、registry.k8s.io、nvcr.io、quay.io、mcr.microsoft.com、docker.elastic.co 等。

流量耗尽错误提示

当返回 402 Payment Required 错误时,表示流量已耗尽,需要充值流量包以恢复服务。

410 错误问题

通常由 Docker 版本过低导致,需要升级到 20.x 或更高版本以支持 V2 协议。

manifest unknown 错误

先检查 Docker 版本,版本过低则升级;版本正常则验证镜像信息是否正确。

镜像拉取成功后,如何去掉轩辕镜像域名前缀?

使用 docker tag 命令为镜像打上新标签,去掉域名前缀,使镜像名称更简洁。

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