takepwave/sagemath

Sagemath Docker环境

镜像概述和主要用途

本镜像提供基于PPA的Sagemath 7.3运行环境，集成了多种科学计算、数据分析及机器学习工具。支持字符界面直接使用Sagemath，也可通过Jupyter Notebook进行交互式计算，适用于数学研究、数据分析、机器学习开发及教育场景。

核心功能和特性

预装系统包

• 图像处理：libmagickwand-dev（图像转换）
• 数据分析工具：jags（阶层贝叶斯解析）、gdal-bin（地理数据转换）
• 日本语处理：mecab、libmecab-dev、mecab-ipadic-utf8（日本语形态素解析）
• 构建工具：build-essential、cmake、unzip
• 科学计算库：libopenblas-dev、liblapack-dev（BLAS）、libhdf5-serial-dev（HDF5）
• 可视化工具：graphviz（Keras模型描画）、fonts-ipafont（日本语字体）
• 其他工具：openscad（Script CAD）、python-opengl（OpenAI动画）、xvfb（虚拟显示）

预装Python包

• 数据分析：pandas、ggplot、seaborn、xlsWriter、xlrd、xlwt
• 科学计算：numpy-stl、wfdb
• 机器学习：sklearn、tensorflow、keras、pytorch、torchvision
• 可视化：Wand、python-nvd3、pydot-ng、JSAnimation
• 其他工具：pyjags、mecab-python、doc2tex、gym（OpenAI）

预装R包

• ggplot2、jsonlite、glmmML、coda、rjags、car、FNN、MASS

使用方法和配置说明

字符界面使用

直接启动Sagemath字符界面：

bash
docker run -i -t takepwave/sagemath

Jupyter Notebook使用

基本启动（注意：存在Sage kernel启动时崩溃的问题）

bash
docker run -p 127.0.0.1:8888:8888 -d -t takepwave/sagemath /opt/sage_launcher \
  --notebook=ipython --ip='*' --port=8888

临时解决内核崩溃问题

使用以下命令启动：

bash
docker run -p 127.0.0.1:8888:8888 -d -t takepwave/sagemath /opt/sage_launcher \
  -sh -c "ipython notebook --no-browser --ip='0.0.0.0' --port=8888"

启动后，在浏览器访问：http://localhost:8888/

OpenAI动画支持

如需显示OpenAI动画，需在后台启动xvfb服务器：

bash
docker run -p 127.0.0.1:8888:8888 -d -t takepwave/sagemath /opt/sage_launcher \
  -sh -c "nohup xvfb-run -s '-screen 0 1400x900x24' ipython notebook --no-browser --ip='0.0.0.0' --port=8888"

挂载本地目录

通过-v参数将本地笔记本目录挂载到容器中：

bash
docker run -v 本地笔记本路径:/home/sage/notebook \
  -p 127.0.0.1:8888:8888 -d -t takepwave/sagemath /opt/sage_launcher \
  -sh -c "ipython notebook --no-browser --ip='0.0.0.0' --port=8888"

示例（挂载本地$HOME/proj/jupyter/MySageMath/notebook/目录）：

bash
docker run -v $HOME/proj/jupyter/MySageMath/notebook/:/home/sage/notebook \
  -p 127.0.0.1:8888:8888 -d -t takepwave/sagemath /opt/sage_launcher \
  -sh -c "ipython notebook --no-browser --ip='0.0.0.0' --port=8888"

容器操作

查看容器状态

bash
# 查看运行中容器
docker ps

# 查看所有容器（包括已停止）
docker ps -a

示例输出：

CONTAINER ID        IMAGE                COMMAND                  CREATED             STATUS              PORTS                      NAMES
4a704622db7a        takepwave/sagemath   "/opt/sage_launcher -"   45 minutes ago      Up 45 minutes       127.0.0.1:8888->8888/tcp   berserk_stonebraker

停止容器

使用docker stop命令，需指定容器ID：

bash
docker stop 4a704622db7a

重启容器

使用docker start命令重启已停止的容器：

bash
# 查看已停止容器
docker ps -a
# 重启容器
docker start 4a704622db7a

Docker安装指南

根据操作系统选择安装方式：

• Mac OSX：Docker for Mac
• Windows 10：Docker for Windows
• CentOS：

  bash
  sudo yum install docker
  

• Ubuntu：

  bash
  sudo apt-get install docker.io