tmfev/gpas

!context

注意 - 已停止维护版本

自2020年起，该软件产品不再在TMF Docker Hub中维护。最新版本以docker-compose形式持续发布于ths-greifswald.de。

如有疑问或建议，请联系我们。

关于gPAS

gPAS（通用假名管理服务）可针对任意字母数字序列生成并管理非确定性假名，支持根据需求定义领域特定的字母表和生成算法，并提供去假名化和***化功能。

可用镜像版本

tmfev/gpas:1.9.1
tmfev/gpas:latest

镜像结构

gPAS Docker镜像基于mosaicgreifswald/wildfly（最新版）扩展，集成了MySQL数据库及gPAS所需的部署文件。容器启动成功后，数据库会自动准备并初始化，随后Wildfly启动并发布EAR和WAR文件。

为提升灵活性和易用性，可访问MySQL数据库，或将主机系统的文件夹挂载为数据库卷。

安装

bash
docker run -p 8080:8080 tmfev/gpas:latest

使用Web界面

容器启动成功后，打开浏览器访问：
http://你的IP:8080/gpas-web

访问gPAS MySQL数据库

• 需暴露3306端口：

  bash
  docker run -p 8080:8080 -p 3306:3306 tmfev/gpas:latest
  

• 数据库凭据：
  user=gpas_user, password=gpas_password

自定义数据库初始化

通过卷挂载主机文件夹中的SQL文件，实现数据库初始化（如导入演示数据或领域配置）：

bash
docker run -p 8080:8080 -v /你的/sql文件路径:/entrypoint-mysql-initfiles tmfev/gpas:latest

Docker外部数据存储

通过卷将数据库内容存储在主机文件系统中：

bash
docker run -p 8080:8080 -v /你的/绝对路径:/entrypoint-mysql-data tmfev/gpas:latest

更多信息

概念与实现：

• Lars Geidel
• Arne Blumentritt

引用文献：

• MOSAIC--A Modular Approach to Data Management in Epidemiological Studies. ([***]
• A workflow-driven approach to integrate generic software modules in a Trusted Third Party. ([***]
• [***]

更多信息：

• 访问[***]
• 查看演示：[***]

许可证

本软件由格赖夫斯瓦尔德大学医学院开发，基于AGPLv3许可证发布，最初由DFG资助的MOSAIC项目（资助编号HO 1937/2-1）提供。 ===END===