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基于单细胞表达数据的基序信息网络推断
该镜像包含MINI-EX管道的所有依赖项,MINI-EX是基于Nextflow DSL2构建的分析管道,旨在利用植物单细胞RNA-Seq数据推断细胞类型特异性基因调控网络。通过该镜像可便捷运行MINI-EX管道,无需手动配置依赖环境。项目源代码仓库见GitHub,使用问题可通过提交issue 反馈。
适用于植物单细胞转录组学研究中,需要通过单细胞RNA-Seq数据推断细胞类型特异性基因调控网络的科研场景。
使用Docker容器执行MINI-EX命令的语法如下:
docker run --rm -v $PWD:/temp -w /temp vibpsb/mini-ex COMMAND [参数]...
--rm:容器运行结束后自动删除-v $PWD:/temp:将当前工作目录挂载到容器内的/temp目录-w /temp:设置容器内的工作目录为/tempvibpsb/mini-ex:Docker镜像名称COMMAND [参数]...:需执行的MINI-EX命令及相关参数
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当返回 402 Payment Required 错误时,表示流量已耗尽,需要充值流量包以恢复服务。
通常由 Docker 版本过低导致,需要升级到 20.x 或更高版本以支持 V2 协议。
先检查 Docker 版本,版本过低则升级;版本正常则验证镜像信息是否正确。
使用 docker tag 命令为镜像打上新标签,去掉域名前缀,使镜像名称更简洁。
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