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mskcc/roslin-variant-vcf2maf
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1万+ 次下载6 年前更新
google/deepvariant
google
Google开发的Docker镜像google/deepvariant，集成基于深度学习的基因组变异检测工具DeepVariant，可从全基因组（WGS）、全外显子（WES）等测序数据中精准识别单核苷酸变异（SNVs）与插入缺失（indels），无需手动配置复杂环境，简化部署流程，凭借深度学习模型提升变异检测准确性，广泛适用于科研机构及临床基因组分析场景。
22 次收藏100万+ 次下载2 个月前更新
imamiland/variant-forge
imamiland
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1万+ 次下载21 天前更新
mskcc/roslin-variant-gatk
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mskcc/roslin-variant-picard
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mskcc/roslin-variant-cmo-utils
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mskcc/roslin-variant-delly
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ikmb/deepvariant
ikmb
基于DeepVariant的Nextflow管道，用于端到端变异检测，从原始fastQ文件生成多样本VCF，预配置适用于CCGA MedCluster。
359 次下载2 年前更新
mskcc/roslin-variant-roslin-qc
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mskcc/roslin-variant-htslib
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mskcc/roslin-variant-abra
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mskcc/roslin-variant-conpair
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mskcc/roslin-variant-vardict
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mskcc/roslin-variant-samtools
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mskcc/roslin-variant-mutect
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mskcc/roslin-variant-remove-variants
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mskcc/roslin-variant-ngs-filters
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mskcc/roslin-variant-list2bed
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mskcc/roslin-variant-htstools
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mskcc/roslin-variant-basic-filtering
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mskcc/roslin-variant-trimgalore
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szarate/t2t_variants
szarate
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1 次收藏100万+ 次下载5 年前更新
vanallenlab/vcf2maf
vanallenlab
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1万+ 次下载7 年前更新
variantdev/mod
variantdev
mod是一款通用包管理器，可补充make和variant等任务运行器与构建工具，能将Git/S3/GCS/HTTP中的文件集转化为带版本化依赖管理的可重用模块，适用于各类项目的依赖版本自动更新与配置管理。
50万+ 次下载3 个月前更新
philipssoftware/variant
philipssoftware
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1.9千+ 次下载1 年前更新
dajunluo/deepvariant
dajunluo
本地运行Google的DeepVariant，无需Google Cloud Platform，已包含适用于全基因组测序(WGS)数据的Inception-V3标准模型，当前版本r0.8.0，暂不支持GPU。
7 次收藏5万+ 次下载7 年前更新
neonvariant/transmute
neonvariant
Transmute是一款免费开源的自托管文件转换工具，专注于隐私保护和自动化，支持本地转换图像、视频、音频、文档等多种格式，无文件大小限制，无需第三方访问文件。
3 次收藏1万+ 次下载1 天前更新
variantconst/openwebui-monitor
variantconst
通过高效的OpenWebUI仪表板优化用户跟踪和配额管理。
1万+ 次下载4 个月前更新
variant3dtech/v3d-base
variant3dtech
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1万+ 次下载6 个月前更新
wenwiliang/germline_variant_snakemake
wenwiliang
该Docker镜像提供基于Snakemake的生殖系变异检测工作流，集成GATK、VarScan和Pindel工具，支持在Dinglab集群、MGI集群及Google Cloud环境运行。
1万+ 次下载6 年前更新
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