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jmonlong/samtools-jm logo

jmonlong/samtools-jm

jmonlong
修改版samtools工具,新增按读名拆分CRAM文件的功能,支持将CRAM转换任务拆分为更小的云作业,降低成本且保证配对读在同一子集。
1万+ 次下载5 年前更新
staphb/samtools logo

staphb/samtools

staphb
基于htslib库的C语言工具,用于处理下一代测序数据
5 次收藏100万+ 次下载2 个月前更新
mgibio/samtools-cwl logo

mgibio/samtools-cwl

mgibio
包含samtools、htslib和tabix的Docker镜像,用于CWL工作流,为解决版本兼容性问题明确安装htslib 1.3.2,镜像版本从v1.0.0开始。
6 次收藏100万+ 次下载3 年前更新
mgibio/samtools logo

mgibio/samtools

mgibio
用于处理高通量测序数据中SAM、BAM等格式文件的工具集Docker镜像,基于HTSlib,提供格式转换、排序、索引及统计等功能。
2 次收藏50万+ 次下载7 个月前更新
biocontainers/samtools logo

biocontainers/samtools

biocontainers
BioContainers是社区驱动的生物信息学容器项目,基于Docker和rkt技术,提供标准化的生物信息学软件容器,支持本地、云环境及HPC集群部署,确保软件运行环境一致性和分析可重复性,适用于基因组学、蛋白质组学等组学领域。
13 次收藏50万+ 次下载6 年前更新
biocontainers/samtools-test logo

biocontainers/samtools-test

biocontainers
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7.5千+ 次下载6 年前更新
nanozoo/samtools logo

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nanozoo
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5.1千+ 次下载2 年前更新
nanozoo/bed_samtools logo

nanozoo/bed_samtools

nanozoo
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41 次下载2 年前更新
biocontainers/bioconductor-rsamtools logo

biocontainers/bioconductor-rsamtools

biocontainers
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574 次下载8 年前更新
davelabhub/samtools logo

davelabhub/samtools

davelabhub
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100万+ 次下载4 年前更新
singlecellpipeline/samtools logo

singlecellpipeline/samtools

singlecellpipeline
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50万+ 次下载6 年前更新
wgspipeline/samtools logo

wgspipeline/samtools

wgspipeline
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10万+ 次下载5 年前更新
jweinstk/samtools logo

jweinstk/samtools

jweinstk
用于生物信息学工作流中,将CRAM文件转换为BAM文件的最小化Samtools Docker容器。
1 次收藏10万+ 次下载9 年前更新
halllab/samtools logo

halllab/samtools

halllab
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10万+ 次下载7 年前更新
broadgdac/samtools logo

broadgdac/samtools

broadgdac
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10万+ 次下载5 年前更新
lethalfang/samtools logo

lethalfang/samtools

lethalfang
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10万+ 次下载2 年前更新
kfdrc/samtools logo

kfdrc/samtools

kfdrc
alpine based samtools
2 次收藏10万+ 次下载6 年前更新
stjudecloud/samtools logo

stjudecloud/samtools

stjudecloud
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5万+ 次下载4 年前更新
qwbroad/samtools logo

qwbroad/samtools

qwbroad
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5万+ 次下载7 年前更新
bioslimcontainers/samtools logo

bioslimcontainers/samtools

bioslimcontainers
Samtools是一套用于处理高通量测序数据的程序套件。
5万+ 次下载1 年前更新
mattwherlock/bwa-samtools logo

mattwherlock/bwa-samtools

mattwherlock
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5万+ 次下载3 年前更新
lifebitai/samtools logo

lifebitai/samtools

lifebitai
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5万+ 次下载5 年前更新
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halllab
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5万+ 次下载6 年前更新
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gatksv/samtools-cloud

gatksv
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5万+ 次下载6 年前更新
mmuddin2020/samtools logo

mmuddin2020/samtools

mmuddin2020
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1万+ 次下载9 个月前更新
dukegcb/bwa-samtools logo

dukegcb/bwa-samtools

dukegcb
计算基因组学工具的版本化容器镜像集合,推送到Docker Hub的dukegcb组织,适用于CWL工作流和Singularity环境。
1万+ 次下载8 年前更新
erictdawson/samtools logo

erictdawson/samtools

erictdawson
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1万+ 次下载5 年前更新
johnkilonzi/samtools logo

johnkilonzi/samtools

johnkilonzi
A docker image for Samtools
1万+ 次下载3 年前更新
njaved/samtools_bedtools logo

njaved/samtools_bedtools

njaved
基于miniconda3基础镜像构建的Docker镜像,集成samtools 1.11和bedtools工具,用于基因组数据处理、比对文件分析及基因组区域操作。
1万+ 次下载4 年前更新
swglh/bedtools-samtools logo

swglh/bedtools-samtools

swglh
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1万+ 次下载3 年前更新
apregier/bcftools_samtools logo

apregier/bcftools_samtools

apregier
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1万+ 次下载6 年前更新
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swglh/bcftools-samtools

swglh
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1万+ 次下载1 年前更新
ernfrid/samtools-1.6_bedtools-2.23.0 logo

ernfrid/samtools-1.6_bedtools-2.23.0

ernfrid
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1万+ 次下载8 年前更新
omicsclass/samtools logo

omicsclass/samtools

omicsclass
omicsclass提供的samtools 1.10镜像,无需繁琐安装即可直接使用samtools工具进行生物信息学序列处理,如FASTA文件索引建立等操作。
6 次收藏1.8千+ 次下载5 年前更新
swerebenchv2/samtools-htslib logo

swerebenchv2/samtools-htslib

swerebenchv2
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3.8千+ 次下载1 个月前更新
nikitamirxes/samtools_downsample logo

nikitamirxes/samtools_downsample

nikitamirxes
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5万+ 次下载2 年前更新
sanogenetics/htslib-bcftools-samtools logo

sanogenetics/htslib-bcftools-samtools

sanogenetics
基于amazonlinux:2,包含htslib、bcftools、samtools工具及AWS CLI,用于处理基因组数据并支持S3文件访问。
1 次收藏1万+ 次下载1 年前更新
biocorecrg/samtools logo

biocorecrg/samtools

biocorecrg
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790 次下载2 年前更新
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