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rosettacommons/rosetta Docker 镜像 - 轩辕镜像

镜像简介

RosettaCommons官方维护的Rosetta/PyRosetta镜像,提供多种构建版本满足不同计算需求,学术和非商业用户可免费使用,商业用途需单独获取许可。

镜像统计信息

收藏数: 11

下载次数: 12026

状态: active

发布者: rosettacommons

类型: 镜像

rosetta
rosettacommons/rosetta
RosettaCommons官方维护的Rosetta/PyRosetta镜像,提供多种构建版本满足不同计算需求,学术和非商业用户可免费使用,商业用途需单独获取许可。
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Rosetta/PyRosetta 官方镜像

镜像概述

本镜像由RosettaCommons(rosettacommons.org)官方维护,包含Rosetta和PyRosetta的构建版本,适用于蛋白质结构预测、设计及相关生物信息学研究。

许可证信息
  • 学术和非商业用户可依据Rosetta软件非商业许可协议和PyRosetta软件非商业许可协议使用本页面所有镜像。
  • 商业用途需购买单独许可(包括学术用户的有偿服务)。更多信息请参见:
    []
    [
    ]
    或发送邮件至***咨询。
技术信息
镜像标签说明
  • serial:包含Rosetta和PyRosetta构建,均启用cxx11thread和serialization扩展。
  • mpi:包含Rosetta和PyRosetta构建,均启用cxx11thread和serialization扩展;Rosetta以MPI模式构建。
  • jupyter:基于jupyter/scipy-notebook,预装PyRosetta。运行本地Jupyter服务器命令:
    bash
    docker run -it -p 8888:8888 rosettacommons/rosetta:jupyter
    
  • ml(实验性):包含Rosetta和PyRosetta构建,启用libtorch和tensorflow集成。
    • Rosetta:启用mpi、cxx11thread、serialization、torch、tensorflow扩展。
    • PyRosetta:启用cxx11thread、serialization、torch、tensorflow扩展。
  • <TAG>-NNN:对应每周NNN版本的镜像。

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 版本下载页面。

国内拉取方式

docker pull docker.xuanyuan.run/rosettacommons/rosetta:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

官方拉取方式

docker pull rosettacommons/rosetta:<标签>

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RosettaCommons官方维护的RFdiffusion协议容器,用于蛋白质结构设计与基序支架构建,支持Docker和Apptainer运行,不兼容ARM架构。
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oldzhang

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