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bioconductor/bioc-redis
bioconductor
Bioconductor内部包，用于为其生成的Docker镜像创建二进制文件，通过在GKE启动的Kubernetes集群并行处理包安装和二进制创建，与Bioconductor/k8sredis Kubernetes应用同步工作。
下载次数: 0状态：社区镜像维护者：bioconductor仓库类型：镜像最近更新：1 年前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明
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BiocKubeInstall
概述与主要用途
BiocKubeInstall是Bioconductor的内部包，主要功能是为Bioconductor生成的Docker镜像创建二进制文件。其包安装和二进制创建过程在Kubernetes集群上并行执行，当前集群通过GKE（Google Kubernetes Engine）启动。该包与Bioconductor/k8sredis Kubernetes应用协同工作，确保流程同步。
核心功能与特性
主要组件
- inst/helm-chart：Kubernetes应用的Helm图表，用于部署和管理K8s集群中的相关资源。
- inst/docker：Kubernetes应用内部使用的Docker镜像，支持集群中的各项任务执行。
- BiocKubeInstall R/：运行在管理器和工作节点副本集上的核心代码，负责协调并行处理流程。
- GitHub Actions：自动化工作流，包括启动集群、部署应用、删除集群，以及每周三次测试二进制包安装的稳定性。
使用场景与适用范围
适用于AnVIL平台及所有继承bioconductor_docker的镜像，用于在这些环境中高效安装和管理Bioconductor相关包的二进制文件。
使用方法与配置说明
在AnVIL平台或继承bioconductor_docker的镜像中，可按以下步骤使用：
- 安装AnVIL包：
rBiocManager::install('Bioconductor/AnVIL')
- 查看仓库配置（应显示Google存储API为首选结果）：
rAnVIL::repositories()
- 安装示例包（如Rhtslib）：
rAnVIL::install('Rhtslib')
作者
- Nitesh Turaga - ***
- Martin Morgan
相关链接
- k8sredis：http://www.github.com/Bioconductor/k8sredis
- 使用教程：https://bioconductor.github.io/BiocKubeInstall/articles/BiocKubeInstall_Tutorial.html
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 bioc-redis 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/bioconductor/bioc-redis:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull bioconductor/bioc-redis:<标签>
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