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hpv-coinfection

cgrlab/hpv-coinfection

cgrlab
自动构建

该镜像提供HPV谱系和共感染分类功能,用于识别人类乳头瘤病毒的谱系类型及共感染情况,支持医学研究与病毒分析场景。

下载次数: 0状态:自动构建维护者:cgrlab仓库类型:镜像最近更新:8 年前
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cgrlab/hpv-coinfection镜像说明

镜像概述

cgrlab/hpv-coinfection镜像实现了HPV LC2分类器,专注于人类乳头瘤病毒(HPV)的谱系鉴定与共感染情况检测,为医学研究、临床分析等场景提供专业的自动化分析工具。

核心功能

  • 精准识别HPV病毒的谱系类型
  • 检测样本中HPV病毒的共感染状态
  • 输出结构化的分类结果报告,便于后续数据处理

使用场景

  • HPV相关医学研究项目的数据分析
  • 临床样本中HPV病毒的谱系与共感染情况筛查
  • 病毒学实验中HPV序列的自动化分类处理

配置说明

  • 输入:支持FASTA格式的HPV序列数据文件
  • 输出:生成包含谱系信息、共感染结果的文本报告
  • 可通过命令行参数调整分析阈值(具体参数可参考镜像内置文档)

部署示例

bash
# 挂载本地数据目录并运行分析
docker run -v /本地数据路径:/data cgrlab/hpv-coinfection \
  --input /data/input.fasta \
  --output /data/hpv_result.txt

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 标签列表页面。

轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 hpv-coinfection 镜像标签

docker pull docker.xuanyuan.run/cgrlab/hpv-coinfection:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

DockerHub 原生拉取命令

docker pull cgrlab/hpv-coinfection:<标签>

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