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Biobase Docker镜像文档

镜像概述和主要用途

该Docker镜像为ppc64le架构提供Biobase R包环境，支持构建和运行包含Biobase的容器，主要用于生物信息学领域的数据分析和相关R语言操作。

支持的标签及对应Dockerfile链接

• latest：https://github.com/ppc64le/build-scripts/blob/master/biobase/Dockerfiles/latest_ubuntu_16.04/Dockerfile

作者

Yugandha deshpande <***>

核心功能和特性

• 提供Biobase R包环境，支持R语言相关操作
• 针对ppc64le架构优化
• 可直接构建并运行容器，快速部署Biobase分析环境

使用场景和适用范围

适用于需要使用Biobase R包进行生物信息学数据分析的场景，尤其适合ppc64le架构环境下的相关研究和开发工作。

使用方法和配置说明

构建和运行容器

1. 构建镜像：

   bash
   $ docker build -t biobase .
   

2. 运行容器：

   bash
   $ docker run -it --name=demo_biobase biobase
   

测试容器工作

1. 进入容器后，输入R启动R shell。

2. 逐行运行以下代码：

   r
   library(Biobase)
   z <- new.env()
   multiassign(letters, 1:26, envir=z)
   contents(z)
   

3. 预期输出：

   $f
   [1] NA
   
   $g
   [1] NA
   
   $h
   [1] NA
   

许可证信息

该镜像使用以下许可证：artistic-2.0、mit + file license、file license、gpl-2、file license、gpl (>= 2)、part of r 3.4.0、unlimited、gpl-2、gpl-3、gpl、gpl (>= 2)、file licence、lgpl (>= 2)

出版声明

"本内容的责任由提供方承担。IBM可能会审查内容以确定其是否违法或违反IBM政策，并且IBM可能会移除或拒绝显示其合理认为违反IBM政策或***的内容。有关更多信息，请参见：

DMCA下架政策：https://help.github.com/articles/dmca-takedown-policy IBM下架和DMCA通知网站：https://www.ibm.com/legal/us/en/dmca.html IBM版权和商标信息网站：https://www.ibm.com/legal/us/en/copytrade.shtml%E3%80%82"

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社区支持

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