neherlab/pangraph

pangraph镜像说明

镜像概述

neherlab/pangraph是一款开源生物信息学工具，专注于多基因组组装序列的对齐处理与泛基因组图构建，帮助研究人员解析物种内的遗传变异与进化规律。工具提供完善的文档与源代码支持，适用于基因组学领域的专业分析场景。

核心功能

• 多基因组组装序列的精准对齐
• 泛基因组图的构建与结构变异展示
• 支持泛基因组数据的后续分析与可视化（需结合官方工具链）

使用场景

• 不同菌株/个体的基因组差异比较
• 物种进化历程与遗传多样性研究
• 泛基因组相关的生物信息学分析任务

配置说明

详细配置与使用指南请参考官方文档：pangraph文档

Docker部署示例

基础运行（查看帮助）

bash
docker run --rm docker.xuanyuan.run/neherlab/pangraph --help

挂载本地数据目录进行分析

bash
docker run --rm -v $(pwd)/input:/input -v $(pwd)/output:/output docker.xuanyuan.run/neherlab/pangraph build --input /input/genomes.fasta --output /output/pangraph.json

注：具体命令参数需根据实际需求参考官方文档调整。