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3d_neighbor_removal

phytooracle/3d_neighbor_removal

phytooracle

该镜像提供3D植物点云相邻植物移除功能,通过DBSCAN聚类和重叠分析,保留最大植物簇的点云,适用于农业植物表型分析场景。

下载次数: 0状态:社区镜像维护者:phytooracle仓库类型:镜像最近更新:10 个月前
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3D相邻植物移除镜像

镜像概述

本镜像专注于3D植物点云的净化处理,针对包含多株植物部分的单株点云数据,通过聚类算法和重叠面积计算,移除相邻植物的点云片段,输出仅保留主体植物的纯净点云。

核心功能

  1. DBSCAN聚类分析:对输入点云进行聚类,识别不同植物的点云簇;
  2. 重叠面积判断:若存在2个及以上大簇,转换为多边形并计算重叠面积,超过50%则合并;
  3. 最大簇保留:最终仅保留最大的点云簇,移除所有相邻植物的点云部分。

使用场景

适用于农业科研、植物表型分析等领域,对已完成预处理、单株裁剪和注册的植物点云数据进行进一步净化,以获取准确的单株植物点云用于后续研究。

配置说明

输入

已完成预处理、后处理、单株裁剪和注册的单株植物点云数据。

输出

包含分割点云的子目录,已移除相邻植物的点云部分。

参数与标志

必选参数

  • 单株植物名称:-plant / --plant_name
  • 数据输出目录:-pod / --data_output_dir,默认值:segmentation_pointclouds
  • 图表输出目录:-fod / --figure_output_dir,默认值:plant_reports
  • Epsilon值:-e / --eps,默认值:0.05
  • 输出文件名:-of / --output_filename,默认值:final.ply

部署示例

假设本地输入目录为./plant_data,输出目录为./results,运行命令:

bash
docker run -v ./plant_data:/input -v ./results:/output phytooracle/3d_neighbor_removal \
  --plant_name "sample_plant" \
  --data_output_dir /output/segmentation \
  --figure_output_dir /output/reports \
  --eps 0.05 \
  --output_filename "cleaned.ply"

镜像拉取方式

您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本,请访问 标签列表页面。

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docker pull docker.xuanyuan.run/phytooracle/3d_neighbor_removal:<标签>

使用方法:

  • 登录认证方式
  • 免认证方式

DockerHub 原生拉取命令

docker pull phytooracle/3d_neighbor_removal:<标签>

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