热门搜索:
resolwebio/chipseq
自动构建
resolwebio
Resolwe-Bio的ChIP-Seq分析Docker镜像，集成多种生物信息学工具，用于染色质免疫沉淀测序数据的预处理、峰值调用与质量控制。
下载次数: 0状态：自动构建维护者：resolwebio仓库类型：镜像最近更新：5 年前
让 AI 帮你使用轩辕镜像？ · 展开查看说明
如果你使用 DeepSeek、元宝 AI、Copilot、ChatGPT 等 AI 工具，协助配置轩辕镜像、编写 docker pull 命令、修改 Docker Compose 镜像地址、配置镜像加速、排查镜像拉取失败、分析报错日志等问题，请先让 AI 阅读并遵守轩辕镜像的规则文档。
只需在 AI 对话中先发送下面这句话即可：
请先完整阅读并严格遵守以下文档中的全部规则与要求：
https://xuanyuan.cloud/agents.md
在未充分阅读并理解该文档前，不要生成任何命令、配置、修改建议、故障排查方案或技术回答。后续所有输出都必须严格以该文档中的规范为最高优先级执行。查看 agents.md 用法指南与完整示范。国内用户首推 元宝 AI、DeepSeek 的深度思考模式，不推荐豆包 AI；Cursor 等编辑器可在对话 @ 该链接，或加入 User Rules。 若 AI 无法访问外链，可 打开说明文档 复制全文粘贴。文档会随站点更新，复制内容可能过期，建议定期检查。
ChIP-Seq分析Docker镜像
镜像概述
本镜像基于docker.io/resolwebio/common（衍生自docker.io/resolwebio/base的ubuntu-18.04版本）构建，是Resolwe-Bio推出的ChIP-Seq（染色质免疫沉淀测序）专用分析镜像，整合了多个行业标准工具。
核心功能
包含以下关键工具：
- bedClip (kent-v373)：BED文件区域裁剪工具
- Bedops (v2.4.32)：基因组区域操作与分析工具
- gawk (v1:4.1.3+dfsg-0.1)：文本数据处理工具
- MACS (v1.4.3) & MACS2 (v2.1.1.20160309)：ChIP-Seq峰值识别工具
- run_spp.R (v1.2，别名spp) & SPP (v1.14)：测序数据质量评估工具
- wigToBigWig (kent-v364)：WIG格式转BigWig格式工具
- ChIPQC (1.22.1)：ChIP-Seq数据质量控制与可视化工具
使用场景
适用于基因组学研究中的ChIP-Seq数据处理场景：
- 测序原始数据的预处理与格式转换
- 染色质结合位点的峰值调用与注释
- 分析结果的质量控制与报告生成
- 基因组区域数据的整合与比较分析
配置说明
- 基础系统：Ubuntu 18.04
- 依赖镜像：
resolwebio/common - 工具版本：详见核心功能列表
部署示例
Docker Run命令（MACS2峰值调用）
bashdocker run --rm -v /本地输入路径:/input -v /本地输出路径:/output resolwebio/chipseq macs2 callpeak -t /input/sample.bam -c /input/control.bam -n /output/peak_result
Docker Compose示例
yamlversion: '3' services: chipseq_analysis: image: resolwebio/chipseq volumes: - ./input:/input - ./output:/output command: macs2 callpeak -t /input/test.bam -c /input/control.bam -g hs -n /output/human_peak
镜像拉取方式
您可以使用以下命令拉取该镜像。请将 <标签> 替换为具体的标签版本。如需查看所有可用标签版本，请访问 标签列表页面。
轩辕镜像加速拉取命令点我查看更多 chipseq 镜像标签
docker pull docker.xuanyuan.run/resolwebio/chipseq:<标签>
DockerHub 原生拉取命令
docker pull resolwebio/chipseq:<标签>
更多 chipseq 镜像推荐
resolwebio/rnaseq
resolwebio
用于RNA-Seq流程的Docker镜像，基于ubuntu-18.04版本的resolwebio/base镜像构建，集成BBMap、Cufflinks、Salmon、STAR等多种生物信息学工具，支持RNA测序数据的处理与分析。
3 次收藏10万+ 次下载
5 年前更新
resolwebio/utils
resolwebio
该Docker镜像基于Ubuntu 18.04，集成FastQC、MultiQC等生物信息学常用工具，用于测序数据质量控制、序列处理及分析结果整合等任务。
5万+ 次下载
7 年前更新
resolwebio/dnaseq
resolwebio
该Docker镜像基于Ubuntu 18.04，集成bamclipper、GATK、LoFreq等生物信息学工具，用于DNA测序（DNA-Seq）相关的数据分析流程。
5万+ 次下载
5 年前更新
resolwebio/latex
resolwebio
包含LaTeX包（TeX Live 2015）及Python绘图库（bokeh、numpy等）的Docker镜像，适用于学术论文排版、技术文档生成及结合数据可视化的场景。
1万+ 次下载
5 年前更新
resolwebio/base
resolwebio
Resolwe Bioinformatics的基础Docker镜像，基于Ubuntu不同版本，用于编写新的生物信息学流程并纳入Resolwe Bio。
1万+ 次下载
5 年前更新
resolwebio/common
resolwebio
包含多种常用生物信息学工具的Docker镜像，适用于基因组数据分析、质量控制、序列比对等生物信息学研究场景。
1 次收藏1万+ 次下载
5 年前更新
镜像拉取常见问题
功能
错误码
用户好评
来自真实用户的反馈，见证轩辕镜像的优质服务
oldzhang
运维工程师
Linux服务器
5
"Docker访问体验非常流畅，大镜像也能快速完成下载。"